| 大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘 |
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| 引用本文： | 邱红梅,郝文媛,高淑芹,马晓萍,郑宇宏,孟凡凡,范旭红,王洋,王跃强. 大豆含硫氨基酸相关酶基因发掘[J]. 遗传, 2014, 36(9) |
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| 作者姓名： | 邱红梅 郝文媛 高淑芹 马晓萍 郑宇宏 孟凡凡 范旭红 王洋 王跃强 |
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| 作者单位： | 大豆国家工程研究中心,吉林省农业科学院大豆研究所,长春130033 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划)项目，现代农业产业技术体系项目，吉林省创新工程项目，吉林省自然科学基金项目，东北农业大学大豆生物学教育部重点实验室开放基金项目 |
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| 摘 要： | 大豆(Glycine max)含硫氨基酸合成途径中的酶基因是含硫氨基酸组分的重要调控基因,发掘相关酶基因对高含硫氨基酸分子育种具有重要意义。文章采用大豆物理与遗传整合图谱,通过BioMercator2.1将113个含硫氨基酸合成途径酶基因及33个控制含硫氨基酸含量的QTL整合到遗传图谱Consensus Map 4.0上,依据酶基因位点与QTL的一致性以及QTL的效应值,初步筛选到16个与含硫氨基酸合成相关的候选基因。通过生物信息学方法对候选基因进行拷贝数、SNP、表达谱等分析,鉴定到12个相关酶基因,分别位于D1a、M、A2、K和G等8个连锁群上。生物信息学分析显示这些基因所在QTL可解释含硫氨基酸遗传变异的6.0%~38.5%,其中9个基因的间接效应值超过10%。12个相关酶基因参与含硫氨基酸代谢的重要途径,且多在子叶、花中高丰度表达,存在丰富的SNP。这些基因可作为候选基因进行功能标记开发,将为大豆分子设计育种奠定基础。
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| 关 键 词： | 大豆 含硫氨基酸 合成途径 酶基因 生物信息学 |
Gene mining of sulfur-containing amino acid metabolic enzymes in soybean |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | soybean(Glycine max) sulfur-containing amino acids synthetic pathways enzyme genes bioinformatics |
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