| 应用液滴数字PCR技术检测rs6983267三种多态性位点 |
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| 引用本文： | 沈阳丽,孙浩,蔡文臣,张品正,王旭莹,尚雨寒,石璐,辛倩倩,郭志义.应用液滴数字PCR技术检测rs6983267三种多态性位点[J].生物化学与生物物理进展,2018,45(11):1160-1165. |
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| 作者姓名： | 沈阳丽 孙浩 蔡文臣 张品正 王旭莹 尚雨寒 石璐 辛倩倩 郭志义 |
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| 作者单位： | 华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000,华北理工大学医学实验研究中心，唐山 063000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31050010)，教育部归国留学基金([2015] No.311), 河北省归国留学人员择优资助项目(C201400358)和华北理工大学大学生创新创业计划(X2015052, X2016121)资助项目 |
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| 摘 要： | 核苷酸的多态性检测在临床以及基础生命科学研究中占据着重要地位.目前基于PCR的探针法应用最为广泛.由于在核苷酸上微小差异,探针的设计往往带有交叉活性反应,这阻碍了qPCR方法的推广.数字PCR(dPCR)是近年来已成功实现商业化的基于单分子分析的核酸检测技术.通过对条件的优化,dPCR可以消除探针的交叉活性,不过目前商业化的dPCR一般只有2个通道,对于同时检测3个多态性需要更加细致的优化.本研究以rs6983267位点的CCAT2基因3种多态性检测为例,利用探针的交叉活性反应检测其3个多态性位点.检测涉及到3个探针:2个针对多态性位点,另1个位于多态性位点外侧作为参照探针.结果表明,成功地区分了3个包含多态性位点基因片段的簇.在本研究中交叉活性反应可以为dPCR留出白空间,利于多样品的检测.
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| 关 键 词： | 数字PCR，核酸多态性，交叉活性探针，rs6983267 |
| 收稿时间： | 2018/7/9 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2018/8/16 0:00:00 |
Assessment of Quality of Tri-allelic Polymorphism Compassing rs6983267 Based on Droplet Digital PCR Taking Advantage of Probe Cross-reactivity |
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| SHEN Yang-Li,SUN Hao,CAI Wen-Chen,ZHANG Pin-Zheng,WANG Xu-Ying,SHANG Yu-Han,SHI Lu,XIN Qian-Qian and GUO Zhi-Yi.Assessment of Quality of Tri-allelic Polymorphism Compassing rs6983267 Based on Droplet Digital PCR Taking Advantage of Probe Cross-reactivity[J].Progress In Biochemistry and Biophysics,2018,45(11):1160-1165. |
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| Authors: | SHEN Yang-Li SUN Hao CAI Wen-Chen ZHANG Pin-Zheng WANG Xu-Ying SHANG Yu-Han SHI Lu XIN Qian-Qian and GUO Zhi-Yi |
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| Institution: | Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China,Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China and Medical Research Center, North China University of Science and Technology, Tangshan 063000, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | digital PCR nucleotide acid polymorphism cross-reactivity probe rs6983267 |
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