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中央戈壁石下生物土壤结皮中细菌群落结构和多样性
引用本文:贾丽娟,唐凯,兰慧青,徐黄纬,国情文,丁悦,谭芳,邢丽华,郭雨晴,冯福应.中央戈壁石下生物土壤结皮中细菌群落结构和多样性[J].微生物学通报,2018,45(12):2603-2613.
作者姓名:贾丽娟  唐凯  兰慧青  徐黄纬  国情文  丁悦  谭芳  邢丽华  郭雨晴  冯福应
作者单位:内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018,内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所 内蒙古 呼和浩特 010018
基金项目:国家自然科学基金(31560030);内蒙古自治区高等学校“青年科技英才支持计划”(NJYT-14-A05);内蒙古农业大学生命科学学院师生协同创新项目(KJCX2016011)
摘    要:【背景】戈壁石下生物土壤结皮(Biological soil crusts,BSCs)中的微生物在干旱、半干旱地区生态系统物质循环中起重要作用,其细菌群落结构和多样性因气候和地理环境的不同而存在较大差异。中央戈壁面积大,其石下BSCs中细菌群落结构和多样性却知之甚少。【目的】比较中央戈壁石下BSCs和周围裸土中细菌群落结构和多样性的异同,揭示环境因子对它们的影响以及细菌之间的相互作用关系。【方法】利用Illumina MiSeq对16S rRNA基因进行高通量测序,使用生物信息学分析方法分析细菌群落结构和多样性及其影响因素;基于CoNet软件绘制物种共现性网络图,利用Cytoscape 3.5.1软件将网络图可视化。【结果】石下BSCs的速效磷(Available phosphorus,AP)、速效氮(Available nitrogen,AN)和叶绿素a (Chlorophyll a,Chl a)的含量均明显高于周围裸土(最高高出471%),而pH则略低于周围裸土;石下BSCs中细菌的最优势菌门为Cyanobacteria(45.85%-53.77%),优势属(9.25%-18.42%)有Trichocoleus、Chroococcidiopsis和属于Cyanobacteria纲的1个未知属;临近裸土中细菌的最优势菌门为Actinobacteria (38.82%-44.69%),优势属(5%)有Arthrobacter、Rubrobacter和其它3个属于放线菌门或酸杆菌门的未知属;在土壤理化因子中,AP对石下细菌群落组成的影响最大;除Actinophytocola属和Cyanobacteria纲中的未知属外,其他微生物之间均存在较强的互作关系,其中以共存的互作关系为主(约占60%),点度中心性、接近中心性和中介中心性均较高的节点都属于Cyanobacteria门和α-Proteobacteria纲。【结论】中央戈壁石下BSCs中的细菌群落结构和多样性明显不同于临近裸土,Cyanobacteria门和α-Proteobacteria纲的细菌是该地区石下早期BSCs形成和发育最初及最重要的驱动力。

关 键 词:石下生物,16S  rRNA基因,高通量测序,物种共现性网络

Diversity and structure of hypolithic bacteria community of Zhongyang Gobi
JIA Li-Juan,TANG Kai,LAN Hui-Qing,XU Huang-Wei,GUO Qing-Wen,DING Yue,TAN Fang,XING Li-Hu,GUO Yu-Qing and FENG Fu-Ying.Diversity and structure of hypolithic bacteria community of Zhongyang Gobi[J].Microbiology,2018,45(12):2603-2613.
Authors:JIA Li-Juan  TANG Kai  LAN Hui-Qing  XU Huang-Wei  GUO Qing-Wen  DING Yue  TAN Fang  XING Li-Hu  GUO Yu-Qing and FENG Fu-Ying
Abstract:
Keywords:Hypoliths  16S rRNA gene  High-throughput sequencing  Co-occurrence network
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