大麦黄矮病毒GAV基因组全序列测定及其结构分析 |
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引用本文: | 晋治波,王锡锋,常胜军,周广和.大麦黄矮病毒GAV基因组全序列测定及其结构分析[J].中国科学C辑,2003,33(6):505-513. |
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作者姓名: | 晋治波 王锡锋 常胜军 周广和 |
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作者单位: | 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室,北京,100094 |
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基金项目: | 国家重大基础研究项目(批准号: TG2000016201)和国家自然科学基金项目(批准号: 39970034)资助 |
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摘 要: | 测定了在中国分离得到由麦二叉蚜和麦长管蚜传播的大麦黄矮病毒GAV的基因组核苷酸全序列, 该病毒分离物的RNA由5685个核苷酸组成, 内含6个开放阅读框架(ORF)和4个非编码区(UTR), 基因组大小和结构与黄症病毒属(Luteovirus)的大麦黄矮病毒PAV(BYDV-PAV)和MAV(BYDV-MAV)相似. 序列分析表明, 它与BYDV-MAV的PS1分离物基因组序列的同源性最高. 在6个开放阅读框架中, 除ORF6核苷酸序列同源性为72.0%外, 其他ORF的核苷酸序列同源性均大于90%. 两者全基因组的同源性为90.4%. 推导的编码产物氨基酸序列同源性除P6和通读蛋白(RTP)分别为67.4%和87.4%外, 其他均大于90%, 其中外壳蛋白(CP)为95.5%. 根据与BYDV-MAV的相似性, BYDV-GAV应是一种与BYDV-MAV类似的病毒.
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关 键 词: | 基因组结构 分类学 大麦黄矮病毒GAV |
收稿时间: | 2003-04-17 |
修稿时间: | 2003年4月17日 |
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