| 冬凌草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因克隆与表达分析 |
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| 引用本文： | 朱畇昊,苏秀红,董诚明,陈随清,邵远洋,张风波.冬凌草1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶基因克隆与表达分析[J].广西植物,2016,36(12):1476-1482. |
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| 作者姓名： | 朱畇昊 苏秀红 董诚明 陈随清 邵远洋 张风波 |
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| 作者单位： | 1. 河南中医药大学 药学院,郑州450006;河南中医药大学 呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,郑州450046;2. 河南中医药大学 药学院,郑州,450006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(81173486); 河南中医学院创新人才项目(2011XCXRC02); 河南省高等学校青年骨干教师计划项目(2011GGJS-089)[Supported by the National Natural Science Foundation of China(81173486); Foundation for University Key Teachers in Henan Province(2011GGJS-089); Innovative Talents of Henan University of Traditional Chinese Medicine(2011XCXRC02)]。 |
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| 摘 要： | 1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸合成酶(1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase,DXS)是植物萜类代谢通路中2-C-甲基-D-赤藓糖醇-4-磷酸(MEP)途径的第一个关键酶,在植物萜类物质的生物合成中发挥重要的作用.为了研究该基因在冬凌草二萜类成分合成中的作用,该研究在冬凌草转录组测序结果的基础上设计一对特异性引物,采用RT-PCR方法得到冬凌草IrDXS基因cDNA全长序列,并对其蛋白进行理化性质分析、信号肽预测、亚细胞定位预测、蛋白质二级结构、三级结构预测分析及跨膜域分析等生物信息学分析,同时利用实时荧光定量PCR的方法检测IrDXS基因在冬凌草不同部位中的表达情况.结果表明:从冬凌草叶片中分离得到了一条编码DXS的全长基因,通过生物信息学软件分析发现,该基因编码全长2169 bp,编码722个氨基酸,分子量为77.7 kD.多序列比对发现该基因编码的蛋白和其他植物中已知的DXS蛋白序列具有较高的同源性,N端均包含了一段质体转运肽序列,并均具有一个保守的焦磷酸硫胺素结构域和与吡啶结合相关的DRAG结构域.序列进化树分析显示,IrDXS基因属于植物DXS2家族.DXS基因在冬凌草根中表达量最高、愈伤组织中最低.该研究首次获得了IrDXS基因的全长cDNA序列,并揭示了其在不同组织中的表达差异,为后续的深入研究IrDXS基因在冬凌草二萜类成分合成途径中的功能奠定了基础.
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| 关 键 词： | 冬凌草 DXS基因 生物信息学分析 荧光定量PCR 二萜 |
| 收稿时间： | 2015/11/10 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2016/3/23 0:00:00 |
Cloning and expression analysis of 1-deoxy-D-xylulose
5-phosphate synthase gene in Isodon rubescens |
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| ZHU Yun-Hao,SU Xiu-Hong,DONG Cheng-Ming,CHEN Sui-Qing,SHAO Yuan-Yang,ZHANG Feng-Bo.Cloning and expression analysis of 1-deoxy-D-xylulose
5-phosphate synthase gene in Isodon rubescens[J].Guihaia,2016,36(12):1476-1482. |
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| Authors: | ZHU Yun-Hao SU Xiu-Hong DONG Cheng-Ming CHEN Sui-Qing SHAO Yuan-Yang ZHANG Feng-Bo |
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| Institution: | 1. School of Pharmacy, Henan University of Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou 450046, China; 2. Collaborative Innovation
Center for Respiratory Disease Diagnosis and Treatment & ChineseMedicine Development of Henan Province,
Henan University of Traditional Chinese Medicine, Zhengzhou 450046, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Isodon rubescens 1-deoxy-D-xylulose 5-phosphate synthase bioinformatic analysis qPCR diterpene |
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