链孢囊菌属3种分子分类方法的对比 |
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引用本文: | 张利平,石 楠,张 晓,吕志堂,杨 润蕾,张秀敏 .链孢囊菌属3种分子分类方法的对比[J].中国生物化学与分子生物学报,2009,25(8):776-782. |
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作者姓名: | 张利平 石 楠 张 晓 吕志堂 杨 润蕾 张秀敏
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作者单位: | (1)河北大学生命科学学院,河北省微生物多样性研究与应用重点实验室,保;定071002;2)河北师范大学生命科学学院,石家庄050016); |
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摘 要: | 链孢囊菌属(Streptosporangium)是链孢囊菌科(Streptosporangiaceae)的模式属,包含13个种.种的鉴别通常是多相分类方法,其中尤以DNA同源性分析为国际公认的定种标准;全基因组杂交同源性在70%以下的为不同种.但在进行大量菌株的比对时操作比较复杂.本实验以链孢囊菌属15株标准菌株为实验菌株,选择适宜引物,对其基因组DNA的16S-23S rDNA 间隔区序列(ITS)和REP序列进行了扩增,分别获得了两种基因指纹图谱,并通过UPGMA聚类法构建了相应的进化距离树图.结果表明,对于链孢囊菌属中不同种的区分,两种基因图谱技术的分辨力相当,且两种方法呈现的菌株间同源性与DNA-DNA杂交的结果吻合,有望为链孢囊菌属分类学的研究提供简单、准确、快速的标准程序.
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关 键 词: | 16S-23SrDNA间隔区序列 REP-PCR 链孢囊菌属 |
收稿时间: | 2009-3-3 |
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