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应用改进的通用荧光PCR引物进行多重STR分型
引用本文:张超,范忠鹏,朱旺升,赵莹,陈绅波,李凯,周宇荀,肖君华.应用改进的通用荧光PCR引物进行多重STR分型[J].动物学杂志,2008,43(3):75-80.
作者姓名:张超  范忠鹏  朱旺升  赵莹  陈绅波  李凯  周宇荀  肖君华
作者单位:1. 东华大学化学化工与生物工程学院生物科学与技术研究所,上海,201600
2. 东华大学化学化工与生物工程学院生物科学与技术研究所,上海,201600;上海市实验动物研究所-复旦大学-东华大学模式动物生物多样性联合实验室,上海,201200
摘    要:通过设计通用荧光PCR引物并结合DNA测序系统建立了小鼠的多重STR分型方案.实验针对小鼠基因组设计了两对不同的通用引物序列,标记了FAM荧光的通用序列和"加尾"的位点特异性引物共同用于小鼠的多重PCR的STR基因分型.本研究优化了通用引物和特异性引物间的比例,优化了多重STR-PCR的反应条件,并最终利用该技术方案实现了五重STR分型.实验验证了该方案在多重STR分型中的可行性.与传统的荧光检测PCR产物方案相比,应用通用方案完成多重PCR反应大大节省了实验时间与经费.

关 键 词:通用引物  STR  多重PCR  基因分型  应用  改进  荧光检测  基因分型  Fluorescent  Universal  Improved  Genotyping  时间  反应条件  通用方案  实验验证  方案实现  利用  比例  位点特异性引物  优化  研究  序列  通用引物
文章编号:0250-3263(2008)03-75-06
收稿时间:2007/11/2 0:00:00
修稿时间:2007年11月2日

Multiplex STR Genotyping with Improved Universal Fluorescent PCR Primers
ZHANG Chao,FAN Zhong-Peng,ZHU Wang-Sheng,ZHAO Ying,CHEN Shen-Bo,LI Kai,ZHOU Yu-Xun and XIAO Jun-Hua.Multiplex STR Genotyping with Improved Universal Fluorescent PCR Primers[J].Chinese Journal of Zoology,2008,43(3):75-80.
Authors:ZHANG Chao  FAN Zhong-Peng  ZHU Wang-Sheng  ZHAO Ying  CHEN Shen-Bo  LI Kai  ZHOU Yu-Xun and XIAO Jun-Hua
Institution:ZHANG Chao FAN Zhong-Peng ZHU Wang-Sheng ZHAO Ying CHEN Shen-BoLI Kai ZHOU Yu-Xun XIAO Jun-Hua ( Institute of Biology Science & Technology,Donghua University,Shanghai 201600, Joint Laboratory of Model Animal Biodiversity,Shanghai 201200,China)
Abstract:This study established a multiplex STR genotyping system through universal fluorescent primers in combination with sequencing.For each panel of multiplex STR genotyping amplification,two sets of primers were used,namely universal primers labeled with FAM and specific primers with an added 5' tail.We optimized the proportion of universal and specific primers and reaction of multiplex PCR was achieved.By using this method,five STR marker loci genotyping were successfully conducted within a single reaction.The...
Keywords:Universal primers  STR  Multiplex polymerase chain reaction  Genotyping  
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