辽宁碱蓬甜菜碱醛脱氢酶基因（BADH）启动子分离及序列分析

根据已知的辽宁碱蓬BADH cDNA 5′端序列设计两个基因特异的反向引物（BR1，BR2），通过衔接头PCR获得了BADH基因起始密码子上游265 bp的序列。根据所获得的序列设计两个基因特异的反向引物（BR3，BR4），用BR2、BR3、BR4分别与4个简并引物配对，通过TAILPCR扩增，获得了约2 kb 的序列。经Sequencer软件拼接上述两段序列，获得了BADH基因起始密码子上游2055 bp的序列。用TSSPTCM软件分析此序列，预测出转录起始点（T）位于起始密码子上游62 bp处，由此获得了1993 bp的SlBADH启动子序列。用PLACE软件分析此序列，发现该序列具有启动子的基本元件TATAbox、CAATbox，包含多个胁迫诱导元件，如盐诱导元件GAAAAA，抗冻、缺水、脱落酸、抗寒元件CANNTG，伤害诱导元件ANATTNCNN，热激元件ATAAATGT等，是一个强的胁迫诱导启动子。