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黄淮海地区玉蜀黍黑粉菌群体遗传结构分析
引用本文:张家齐,马红霞,郭宁,张海剑,石洁. 黄淮海地区玉蜀黍黑粉菌群体遗传结构分析[J]. 菌物学报, 2019, 38(2): 210-221. DOI: 10.13346/j.mycosystema.180236
作者姓名:张家齐  马红霞  郭宁  张海剑  石洁
作者单位:河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室 河北保定071000;河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室 河北保定071000;河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室 河北保定071000;河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室 河北保定071000;河北省农林科学院植物保护研究所河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心农业部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室 河北保定071000
基金项目:国家现代化农业产业技术体系(CARS-02);国家重点研发计划(2018YFD0200602)
摘    要:利用17个多态性ISSR引物对2017年在我国黄淮海地区采集的41株玉蜀黍黑粉菌Ustilago maydis样本进行了种群遗传结构分析。基于UPGMA法和贝叶斯模型对玉蜀黍黑粉菌群体遗传结构分析显示,采集的样本可以分为两大群,且种群的划分表现出了与来源地理纬度的一致性。因此按照各样本所属地理纬度将样本分为北纬33°-34°、北纬35°-36°、北纬37°-38° 3大种群。结果表明,分离自北纬33°-34°地区的玉蜀黍黑粉菌遗传多样性最丰富,Nei’s基因多样性(H)为0.2216,Shannon指数(I)为0.3300。分子方差分析(AMOVA)显示,变异中来自种群内部的变异为86%,种群间变异14%(φpt=0.141)。

关 键 词:玉蜀黍黑粉菌  黄淮海  遗传结构  ISSR
收稿时间:2018-09-04

Population genetic structure of Ustilago maydis collected from Huang-Huai-Hai region
ZHANG Jia-Qi,MA Hong-Xia,GUO Ning,ZHANG Hai-Jian,SHI Jie. Population genetic structure of Ustilago maydis collected from Huang-Huai-Hai region[J]. Mycosystema, 2019, 38(2): 210-221. DOI: 10.13346/j.mycosystema.180236
Authors:ZHANG Jia-Qi  MA Hong-Xia  GUO Ning  ZHANG Hai-Jian  SHI Jie
Affiliation:Plant Protection Institute, Hebei Academy of Agricultural and Forestry Sciences/Integrated Pest Management Center of Hebei Province/Key Laboratory of Integrated Pest Management on Crops in Northern Region of North China, Ministry of Agriculture, Baoding, Hebei 071000, China
Abstract:To determine the population genetic structure of Ustilago maydis, 41 isolates collected from Huang-Huai-Hai region in 2017 were analyzed by using 17 polymorphic ISSR primers. The unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) and the Bayesian analysis were used to analyse the population genetic structure of the collected isolates. It was indicated that the isolates could be divided into two geographical groups, and the groups showed clear relationship with the geographical origin of the isolates. Based on demarcation of geographical latitude, the isolates were clustered into 3 groups, 33°-34° N group, 35°-36° N group and 37°-38° N group. The genetic diversity of the 33°-34° N group was the highest. Nei’s gene diversity (H) and Shannon index (I) was 0.2216 and 0.3300, respectively. An estimation of the genetic diversity using analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that the highest variance mainly formed in intrapopulation (86%), and subordinately interpopulation (14%) (φpt=0.141).
Keywords:Ustilago maydis  Huang-Huai-Hai region  population structure  ISSR  
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