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尖孢镰刀菌古巴专化型MAPK FoSlt2敲除突变体的转录组分析
作者姓名:丁兆建  吴小霞  孙君梅  陈丽霞  傅琪彦  许天委
作者单位:琼台师范学院生物教研室 海南海口571127;中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 海南海口571101;琼台师范学院生物教研室 海南海口571127;海南职业技术学院热带农业技术学院 海南海口570216
基金项目:国家自然科学基金(31801690)
摘    要:尖孢镰刀菌古巴专化型Fusarium oxysporum f. sp. cubense(FOC)是威胁香蕉生产的重要土传病原真菌。丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)FoSlt2信号通路在调控尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育、细胞壁完整性和致病性方面发挥着重要作用。为了揭示FoSlt2信号通路的致病机理和寻找农药靶标,本研究利用高通量RNA-seq技术对该病菌野生型菌株和FoSlt2敲除突变体菌株的转录组进行了比较分析,结果表明差异表达基因共有2 164个,其中上调表达基因有1 184个,下调表达基因有980个。Gene Ontology(GO)功能分析结果表明,差异表达基因主要参与在结合、催化分子功能组和代谢过程、细胞过程生物学通路中。KEGG 功能富集分析结果表明,差异基因主要参与戊糖和葡糖醛酸盐转换、氨基糖和核苷酸糖、氨基葡聚糖降解、磷酸肌醇和碳类物质代谢通路,说明这些通路与尖孢镰刀菌古巴专化型的生长发育和致病性相关。该研究为尖孢镰刀菌古巴专化型致病机制的阐明奠定了理论基础。

关 键 词:香蕉枯萎病  尖孢镰刀菌古巴专化型  高通量测序  差异表达基因
收稿时间:2019-03-25
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