| MapGene2Chrom基于Perl和SVG语言绘制基因物理图谱 |
| |
| 引用本文： | 晁江涛,孔英珍,王倩,孙玉合,龚达平,吕婧,刘贯山.MapGene2Chrom基于Perl和SVG语言绘制基因物理图谱[J].遗传,2015(1):91-97. |
| |
| 作者姓名： | 晁江涛 孔英珍 王倩 孙玉合 龚达平 吕婧 刘贯山 |
| |
| 作者单位： | 中国农业科学院烟草研究所，烟草行业烟草基因资源重点实验室，青岛 266101 |
| |
| 基金项目： | 中国烟草总公司科技重大专项(编号:110201301005[JY-05])项目资助 |
| |
| 摘 要： | 遗传图谱表现形式简洁明了,为分析遗传规律、克隆基因提供了便利。Gbrowse、MapViewer等工具虽然能够协助研究人员绘制相似形式的物理图谱,但有很大的局限性:(1)数据需提前布置好;(2)输出结果无法灵活修改。鉴于此,文章基于Perl和SVG语言,开发了一款生物辅助作图软件MapGene2Chrom的本地版与网页版,该软件能够依据输入数据快速绘制相应的物理图谱。该软件输入数据格式简单,输出结果易于修改,图片格式为SVG矢量图,具有很好的移植性,以期为研究人员绘制物理图谱提供便利。
|
| 关 键 词： | 物理图谱 基因分布图 SVG矢量图 作图 生物软件 |
MapGene2Chrom,a tool to draw gene physical map based on Perl and SVG languages |
| |
| Jiangtao Chao
,
Yingzhen Kong
,
Qian Wang
,
Yuhe Sun
,
Daping Gong
,
Jing Lv
,
Guanshan Liu.MapGene2Chrom,a tool to draw gene physical map based on Perl and SVG languages[J].Hereditas,2015(1):91-97. |
| |
| Authors: | Jiangtao Chao Yingzhen Kong Qian Wang Yuhe Sun Daping Gong Jing Lv Guanshan Liu |
| |
| Institution: | Jiangtao Chao;Yingzhen Kong;Qian Wang;Yuhe Sun;Daping Gong;Jing Lv;Guanshan Liu;Key Laboratory for Tobacco Gene Resources, Tobacco Research Institute of Chinese Academy of Agricultural Sciences; |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | physical map gene distribution map SVG vector graph draw map bio-software |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
