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The Ubiquitin Interacting Motif-Like Domain of Met4 Selectively Binds K48 Polyubiquitin Chains
Authors:Mark Villamil  Weidi Xiao  Clinton Yu  Lan Huang  Ping Xu  Peter Kaiser
Affiliation:1. Department of Biological Chemistry, School of Medicine, University of California Irvine, Irvine, California, USA;2. State Key Laboratory of Proteomics, Beijing Proteome Research Center, National Center for Protein Sciences (Beijing), Institute of Lifeomics, Beijing, China;3. Department of Physiology & Biophysics, University of California Irvine, Irvine, California, USA
Abstract:
Keywords:Ubiquitin  K48  ubiquitin binding domain  ubiquitin interacting motif  met4  ubiquitin probe  4xUb"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0020"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  tetra-ubiquitin  ACN"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0030"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  acetonitrile  BLI"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0040"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  biolayer interferometry  BSA"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0050"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  bovine serum albumin  DTT"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0060"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  dithiothreitol  DUB"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0070"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  deubiquitinating enzymes  E1"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0080"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin-activating enzyme  E2"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0090"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin-conjugating enzyme  E3"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0100"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin ligase  EDTA"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0110"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ethylenediaminetetraacetic acid  FA"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0120"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  formic acid  IPTG"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0130"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  isopropyl β-d-1-thiogalactopyranoside  LC MS/MS"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0140"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  liquid chromatography tandem mass spectrometry  MGF"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0150"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  Mascot Generic Format  NHS"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0160"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  N-hydroxysuccinimide  PBS"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0170"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  phosphate-buffered saline  PMSF"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0180"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  phenylmethylsulfonyl fluoride  SILAC"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0190"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  stable isotope labeling by amino acids in cell culture  SRM"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0200"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  selective reaction monitoring  TBS"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0210"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  tris-buffered saline  tUBD"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0220"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  tandem ubiquitin binding domain  TUBEs"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0230"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  tandem ubiquitin binding entities  UBD"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0240"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin-binding domains  UIM"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0250"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin interacting motif  UIML"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0260"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  ubiquitin interacting motif like domain  XIC"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0270"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  extracted ion chromatogram  YPD"  },{"  #name"  :"  keyword"  ,"  $"  :{"  id"  :"  kwrd0280"  },"  $$"  :[{"  #name"  :"  text"  ,"  _"  :"  yeast extract peptone dextrose
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