δ差异显示筛选武定乌骨鸡"乌色"性状相关基因

“乌色”是乌骨鸡的一个主要性状，乌骨鸡的经济价值与药用价值关键在于乌骨鸡的“乌色”性状。为筛选与乌骨鸡“乌色”性状可能相关的基因，应用δ差异显示方法，系统比较全同胞武定乌骨鸡与非乌骨鸡的基因表达情况，回收、再扩增与纯化差异片段，并通过Northern blot验证、克隆和测序后，获得29个ESTs。序列分析结果表明，有8个ESTs分别与鸡已知基因骨骼肌-β原肌球蛋白基因(A17)、贲门肌球蛋白碱轻链基因(B57)、插入激活ras致癌基因(A36)、fra-2致癌基因(B36)、16S rRNA基因(A35)及线粒体基因组序列(D36、C39和D9)同源，序列相似性分别为97％、100％、98％、98％、98％、99％、99％和97％。5个ESTs分别与其他生物已知基因同源，它们是人TTN基因转录本变异novex-2(B53)、人磷酸葡糖变位酶5基因(B109)、人信号识别物54kD基因(B20)、人与鼠核糖核酸酶／血管形成抑制因子基因(C26、D31)，差异片段与它们的序列相似性分别为82％、82％、87％、99％和99％，这些基因在鸡中还没被克隆。13个ESTs属于新基因片段，其中9个与数据库中ESTs序列相似性较高，4个属于全新基因片段，在数据库中没有与它们序列相似性较高的ESTs。选择16条差异片段，根据测序结果设计特异性引物，利用12个随机采集的武定乌骨鸡或非乌骨鸡样本，进行基因表达分析，结果表明，1个新基因(A7)片段、2个已知基因(插入激活ras致癌基因A36、信号识别物54kD基因B20)片段具有乌骨鸡或非乌骨鸡表达特异性，从而初步确定它们与武定乌骨鸡“乌色”性状相关。

Screening Genes Related to 'Black' Character in Wu-Ding Chicken by Delta Differential Display