| 草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定 |
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| 引用本文： | 朱刚,吴林,陈明杰,汪虹,谭琦,鲍大鹏. 草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定[J]. 菌物学报, 2013, 32(5): 919-927 |
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| 作者姓名： | 朱刚 吴林 陈明杰 汪虹 谭琦 鲍大鹏 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学食品科学与工程学院 上海201306国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;国家食用菌工程技术研究中心 农业部南方食用菌资源利用专业重点实验室 上海市农业遗传育种重点开放实验室 上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403 |
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| 基金项目： | 上海市科委重点项目（No. 10dz2212400）；上海市农委重点攻关项目[沪农科攻字（2011）第1–2号] |
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| 摘 要： | 在草菇全基因组中发现了4个担子菌锰过氧化物酶MnP基因同源物(vv-mnp1、vv-mnp2、vv-mnp3和vv-mnp4)的基础上,对这4个MnP进行了生物信息学分析,并对其基因表达和酶活性进行测定。结果表明vv-mnp1与vv-mnp2基因结构相同,vv-mnp3与vv-mnp4基因结构相似。在4个草菇MnP基因启动子区域存在AP-2、cAMP、MRE、XRE和HSE等调控元件,预示着草菇中MnP基因的转录可能会受到氮源、碳源、重金属离子、芳香族化合物以及热击的影响。草菇MnP具有信号肽,不存在跨膜区域,表明其是分泌蛋白。草菇MnP中形成4个二硫键的8个半胱氨酸、潜在的锰离子和钙离子结合位点,在担子菌MnP中高度保守。系统进化树分析显示草菇MnP1和MnP2与香菇MnP1亲缘关系最近,而MnP3和MnP4与灰盖鬼伞过氧化物酶有较近的亲缘关系。RT-PCR检测到vv-mnp1、vv-mnp3与vv-mnp4能在含锰离子的培养基中表达,但运用锰离子氧化法没有检测到MnP活性,推测草菇中的MnP不具有将Mn2+氧化成Mn3+的能力。
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| 关 键 词： | 草菇 锰过氧化物酶 生物信息学 RT-PCR |
Bioinformatic, gene expression and enzyme activity analyses of manganese peroxidases in Volvariella volvacea |
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| ZHU Gang,WU Lin,CHEN Ming-Jie,WANG Hong,TAN Qi and BAO Da-Peng. Bioinformatic, gene expression and enzyme activity analyses of manganese peroxidases in Volvariella volvacea[J]. Mycosystema, 2013, 32(5): 919-927 |
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| Authors: | ZHU Gang WU Lin CHEN Ming-Jie WANG Hong TAN Qi BAO Da-Peng |
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| Affiliation: | College of Food Sciences and Technology, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China;National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Applied Mycological Resources and Utilization, Ministry of Agriculture; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible Fungi, Shanghai Academy of Agricultural Sciences, Shanghai 201403, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Volvariella volvacea manganese peroxidase bioinformatics RT-PCR |
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