首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

SPP1在头颈部鳞状细胞癌的免疫浸润及临床相关性分析
作者姓名:杨开炎  黄兰诚  林钻平  唐凤珠  李旭祥  冯大益
作者单位:广西中医药大学瑞康临床医学院,南宁 530000 ;广西壮族自治区人民医院 耳鼻咽喉头颈科,南宁 530000;广西百色市人民医院 耳鼻咽喉头颈外科,广西 百色 533000;广西百色市人民医院 病理科,广西 百色 533000
基金项目:国家自然科学基金项目(No.82060190);广西卫健委科研课题(No.Z20211109);广西科技基地和人才专项(No.桂科AD20297069).
摘    要:
探讨分泌型磷蛋白1 (Secreted Phosphoprotein 1,SPP1)在头颈部鳞状细胞癌(Head and neck squamous cell carcinoma, HNSC)中与免疫浸润及临床的相关性,明确SPP1在HNSC预后和个体化治疗中的潜在价值。使用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)HNSC数据分析SPP1表达。使用来自TCGA的临床生存数据评估SPP1的临床预后价值。使用R语言的clusterProfiler包进行SPP1相关的富集分析。使用R语言的CIBERSORT函数评估22种肿瘤浸润免疫细胞在HNSC中的浸润情况,分析肿瘤浸润免疫细胞与SPP1表达之间的关联。差异表达分析发现SPP1在HNSC中高表达(P<0.001),临床相关性分析发现SPP1表达与T分期(P=0.001)、临床分期(P=0.013)相关,SPP1高表达患者的总生存期明显短于低表达患者(P=0.020 4)。基因富集分析发现SPP1在HNSC中与免疫学功能及免疫相关通路有关联。肿瘤浸润免疫细胞分析发现在高SPP1表达组中,M2巨噬细胞(...

关 键 词:头颈部鳞状细胞癌  免疫浸润  肿瘤预后  SPP1  CIBERSORT
收稿时间:2021-09-20
修稿时间:2021-11-20
点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息
点击此处可从《生物信息学》下载免费的PDF全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号