分子伴侣HdeA与底物蛋白SurA作用机制的模拟研究 |
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作者姓名: | 周丹丹 于延庆 吴昊 李艳妮 乔建军 |
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作者单位: | 天津大学化工学院制药工程系,系统生物工程教育部重点实验室,天津 300072,上海药明康德新药开发有限公司,上海 200131,天津大学化工学院制药工程系,系统生物工程教育部重点实验室,天津 300072,天津大学化工学院制药工程系,系统生物工程教育部重点实验室,天津 300072,天津大学化工学院制药工程系,系统生物工程教育部重点实验室,天津 300072 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31570049)资助项目 |
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摘 要: | 分子伴侣HdeA与底物蛋白间的相互作用可帮助底物蛋白复性,这是肠道致病菌得以在酸性环境中幸存的重要原因之一.为探究HdeA发挥伴侣活性的作用机制,本研究采用分子对接和分子动力学的方法,模拟了HdeA与底物蛋白SurA间的相互作用,计算了二者的结合自由能.通过分析HdeA-SurA复合物体系的作用模式、氢键作用以及能量分解的结果,确定了HdeA与底物蛋白SurA结合时发挥重要作用的关键氨基酸残基.该研究结果为以后采用实验手段探究HdeA与底物蛋白之间的作用提供了重要的理论参考,同时为今后设计与开发HdeA的抑制剂提供了理论指导依据.
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关 键 词: | HdeA 分子伴侣 SurA 分子对接 分子动力学 |
收稿时间: | 2016-11-02 |
修稿时间: | 2017-02-14 |
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