| 产电微生物基因调控网络的构建和特异性通路分析 |
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| 引用本文： | 徐军,刘翠翠,丁德武,孙啸,谢建明. 产电微生物基因调控网络的构建和特异性通路分析[J]. 中国生物工程杂志, 2014, 34(11): 42-46. DOI: 10.13523/j.cb.20141106 |
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| 作者姓名： | 徐军 刘翠翠 丁德武 孙啸 谢建明 |
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| 作者单位： | 东南大学生物电子学国家重点实验室 生物科学与医学工程学院 南京 210096 |
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| 摘 要： | 研究产电微生物胞外电子传递过程和机制,发现与产电效率相关的关键基因、通路和代谢物,是微生物燃料电池研究中的关键技术。为了发现在胞外电子传递过程中起到关键作用的基因以及通路,首先利用比较基因组学的方法,以模式微生物大肠杆菌和同属希瓦氏菌的其他菌株为参考,构建了Shewanella.onedensis MR-1的全基因组基因转录调控网络,大大扩展了目前已知的基因调控关系。然后以此网络为基础,结合基于蛋白质相互作用分析得到的胞外电子传递通路,构建了与胞外电子传递直接传递密切相关的细胞色素C编码基因及其相关调控基因构成的子网络,结合全基因组基因表达数据,研究了特异性条件下胞外电子传递的可能通路和基因调控过程。
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| 关 键 词： | 产电微生物 胞外电子传递 基因转录调控网络 基因表达数据分析 |
| 收稿时间： | 2014-09-20 |
Reconstruction and Analysis of the Gene Regulatory Networks of Shewanella onedensis MR-1 |
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| XU Jun;LIU Cui-cui;DING De-wu;SUN Xiao;XIE Jian-ming. Reconstruction and Analysis of the Gene Regulatory Networks of Shewanella onedensis MR-1[J]. China Biotechnology, 2014, 34(11): 42-46. DOI: 10.13523/j.cb.20141106 |
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| Authors: | XU Jun LIU Cui-cui DING De-wu SUN Xiao XIE Jian-ming |
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| Affiliation: | XU Jun;LIU Cui-cui;DING De-wu;SUN Xiao;XIE Jian-ming;State Key Laboratory of Bioelectronics,School of Biological Science and Medical Engineering; |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Extracellular electron transfer c-type cytochromes Gene expression data Generegulatory networks |
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