| 大肠杆菌编码区碱基片段的分析研究 |
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| 引用本文： | 李宏,罗辽复.大肠杆菌编码区碱基片段的分析研究[J].生物物理学报,2001,17(1):167-173. |
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| 作者姓名： | 李宏 罗辽复 |
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| 作者单位： | 内蒙古大学理论物理和理论生物学研究室, |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目资助 |
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| 摘 要： | 对大肠杆菌1231个编码开始区域和1307个编码终止区域内的6碱基片段、4碱基片段和3碱基片段进行了统计，发现绝大多数4碱基和3碱基模式出现在盯对频率小于2的范围之内；在这两个区域中，出现最多的碱基片段是多聚A；编码开始区域和编码终止区域的碱基构成模式有明显区别；编码开始区域里GGA类的稀有片段恰恰是SD区域最偏好的碱基片段；以TAG或CTA构造的3碱基模式为编码开始区和编码终止区的禁用模式。
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| 关 键 词： | 大肠杆菌 基因编码区 碱基片段 相对频率 |
| 文章编号： | 1000－6737（2001）01－07 |
| 修稿时间： | 2000年9月4日 |
THE STATISTICAL ANALYSIS OF BASE ELEMENTS FOR CODING SEQUENCES IN E.COLI GENES |
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| LI Hong,LUO Liao-fu.THE STATISTICAL ANALYSIS OF BASE ELEMENTS FOR CODING SEQUENCES IN E.COLI GENES[J].Acta Biophysica Sinica,2001,17(1):167-173. |
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| Authors: | LI Hong LUO Liao-fu |
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| Abstract: | code-starting sequences and 1307 code-terminal sequences of E.coli were compiled and the RF (relative frequency) values of 6 base elements, 4 base elements and 3 base elements in the two regions were counted. It was found that most of the 4 base modes and 3 base modes were in the region of RF<2 ; most of the base elements appeared in coding region is poly A; the base modes in code-starting region differ distinctly from that in code-terminal region; the base modes of GGA category in code-starting region are rare modes, but are predominant in SD region; In the two regions, TAG and CTA modes are forbidden. |
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| Keywords: | Coding region of E coli Base element Relative frequency |
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