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数据挖掘技术分析hMTERF1在胃癌中的表达及预后作用
作者姓名:孙美涛  自加吉  杨勇琴  严长宝  戴莉萍  余敏  熊伟
作者单位:大理大学 基础医学院,云南 大理 671000,大理大学 基础医学院,云南 大理 671000,大理大学 基础医学院,云南 大理 671000,大理州人民医院 病理科,云南 大理 671000,大理州人民医院 病理科,云南 大理 671000,云南大学 生命科学学院,昆明 530061,大理大学 基础医学院,云南 大理 671000
基金项目:国家自然科学基金(8,5, 31760331); 云南省教育厅科学研究基金项目(2016ZDX1,6ZDX05);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(2017HB077); 大理大学大学生创新创业计划项目(X-CXCY-2016-13).
摘    要:
为了探讨人线粒体转录终止因子1(human mitochondrial transcription termination factor 1,h MTERF1)在胃癌中的表达及预后意义,利用Bio GPS数据库分析h MTERF1在正常组织中的表达;利用Oncomine数据库检索关于h MTERF1基因的信息,并对h MTERF1基因在胃癌中的表达进行荟萃分析;利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析h MTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响。Bio GPS数据库显示,h MTERF1在人体正常组织中均有表达,其中在心肌组织、子宫体和骨骼肌组织中含量较高。Oncomine数据库中共收集了946个不同类型的h MTERF1研究结果,其中关于h MTERF1表达有统计学差异的研究结果有152个,h MTERF1表达增高的研究有59个,表达降低的研究有93个。共有20项研究涉及h MTERF1在胃癌组织中和正常组织中的表达,包括798例临床样本,与对照组相比,h MTERF1在胃癌中高表达,且差异具有统计学意义(P=0.003)。进一步利用Kaplan-Meier Plotter数据库分析h MTERF1表达对不同Lauren分型胃癌患者生存时间的影响发现,与h MTERF1高表达组相比,h MTERF1低表达组胃癌患者的累积生存时间增高(P=0.045)。在肠型胃癌患者中,h MTERF1高表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.028)。而在弥漫型胃癌患者中,h MTERF1低表达胃癌患者的生存时间增高(P=0.024)。在混合型胃癌患者中,h MTERF1高表达患者与低表达患者生存时间的差异无统计学意义(P=0.310)。研究表明,大样本数据挖掘能迅速准确地获取胃癌组织中h MTERF1表达的相关信息,为深入研究h MTERF1在胃癌发生发展中的作用奠定基础。

关 键 词:hMTERF1  胃癌  数据挖掘  Oncomine数据库  预后
收稿时间:2017-05-25
修稿时间:2017-09-12
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