| 基于高通量RNA测序数据分析的弹性云平台 |
| |
| 引用本文： | 吴一雷,闫鹏程,刘充,陈禹保,赵文明. 基于高通量RNA测序数据分析的弹性云平台[J]. 生物技术进展, 2012, 2(1): 52-56. DOI: 10.3969/j.issn.2095-2341.2012.01.10 |
| |
| 作者姓名： | 吴一雷 闫鹏程 刘充 陈禹保 赵文明 |
| |
| 作者单位： | 1.北京市科学技术研究院, 北京市计算中心, 北京 100012;2.中国科学院, 北京基因组研究所, 北京 100029 |
| |
| 摘 要： | ![]()
高通量RNA测序（RNA-seq）技术为研究人员提供了海量数据,如何对这些数据进行快速有效的分析,并为后续转录组、基因表达等研究提供支持,是生物信息学领域的热点方向。本文讨论了当前RNA-seq数据分析的发展水平和常用软件、算法,并设计了一系列数据处理模块和分析流程。同时,为了给用户提供更好的使用环境,我们设计了基于弹性资源管理系统的生物云平台BioCloud。该平台集成了丰富的软件,采用高灵活度、高扩展性的体系架构,在给用户提供低成本、高性能计算服务的同时,还提供个性化的流程定制服务。
|
| 关 键 词： | 高通量测序 转录组分析 弹性云平台 基因组数据库 分布式系统 |
| 收稿时间： | 2011-12-19 |
RAN-seq Data Analysis Platform on basis of Elastic Cloud Computing |
| |
| WU Yi-lei,YAN Peng-cheng,LIU Chong,CHEN Yu-bao,ZHAO Wen-ming. RAN-seq Data Analysis Platform on basis of Elastic Cloud Computing[J]. CURRENT BIOTECHNOLOGY, 2012, 2(1): 52-56. DOI: 10.3969/j.issn.2095-2341.2012.01.10 |
| |
| Authors: | WU Yi-lei YAN Peng-cheng LIU Chong CHEN Yu-bao ZHAO Wen-ming |
| |
| Affiliation: | 1.Beijing Computing Center, Beijing Academy of Science and Technology, Beijing 100012, China;2.Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100029, China |
| |
| Abstract: | ![]()
|
| |
| Keywords: | next generation sequencing elastic cloud computing genome database distributed system |
|
| 点击此处可从《生物技术进展》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《生物技术进展》下载全文 |
|
