LncRNA63及其共表达基因Hr3在家蚕中的表达和功能分析

【目的】本研究旨在通过对一个新的长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)及其共表达基因在家蚕Bombyx mori中的表达和功能进行分析，进一步阐明lncRNA在调控家蚕变态发育中的分子机制。【方法】基于前期家蚕脂肪体转录组测序数据，我们发现在蜕皮激素20E(2 μg/μL)处理5龄幼虫早期的脂肪体中lncRNA63表达显著上调，家蚕激素受体基因Hr3与之共表达。利用qRT-PCR对lncRNA63和Hr3在家蚕不同发育时期(4-5龄幼虫、蛹和成虫)、5龄幼虫不同组织(头、体壁、血淋巴、中肠、马氏管、脂肪体、丝腺、精巢和卵巢)和2 μg/μL 20E处理2, 6, 12和24 h后5龄幼虫脂肪体中的表达谱进行分析；采用核质分离检测和原位杂交技术检测lncRNA63在家蚕BmN细胞中的定位；利用dsRNA干涉家蚕5龄幼虫个体中lncRNA63的表达，并利用qRT-PCR检测RNA干涉lncRNA63对头、丝腺、脂肪体和体壁中Hr3表达的影响。【结果】qRT-PCR结果表明，lncRNA63和Hr3在家蚕羽化前的蛹末期有一个表达高峰；二者在家蚕5龄幼虫头、体壁和丝腺中都有较高表达；lncRNA63和Hr3在2 μg/μL 20E处理2, 6和12 h的家蚕5龄幼虫脂肪体中较对照组(无水乙醇处理组)都显著上调，24 h下降到与对照组相当水平，二者的表达趋势完全一致。LncRNA63主要定位于BmN细胞核，但20E可诱导lncRNA63的核质迁移。利用dsRNA干涉lncRNA63表达后，Hr3的表达显著下调。【结论】20E不仅可调控lncRNA63的表达，还可诱导lncRNA63的核质迁移；lncRNA63可通过调控共表达基因Hr3的表达参与家蚕的变态发育过程。

Expression and functional analysis of lncRNA63 and its co-expression gene Hr3 inBombyx mori