| 拟南芥和水稻金属蛋白酶ftsH基因家族的基因组比较分析 |
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| 引用本文： | 张杰道,孙爱清.拟南芥和水稻金属蛋白酶ftsH基因家族的基因组比较分析[J].生物工程学报,2009,25(9):1402-1408. |
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| 作者姓名： | 张杰道 孙爱清 |
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| 作者单位： | 1. 山东农业大学生命科学学院,泰安,271018
2. 山东农业大学农学院作物生物学国家重点实验室,泰安,271018 |
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| 基金项目： | 作物生物学国家重点实验室开放课题(No.200706)资助~~ |
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| 摘 要： | FtsH(Filamentation temperature-sensitive H)是一种广泛存在于原核生物和真核生物中的ATP依赖型金属蛋白酶。同源性分析表明,在拟南芥和水稻基因组中分别有12个和9个ftsH基因。ftsH基因在染色体上的分布有明显的偏爱性,如拟南芥的1、2、5号染色体和水稻的1、5号染色体。亚细胞定位分析表明,所有FtsH蛋白均定位于叶绿体或线粒体中。系统进化分析表明,21个FtsH蛋白成员可分为8个类群,其中AtFtsH12在水稻中没有发现种间同源物。每个类群成员的蛋白序列高度保守,种内同源物显示出大于80%的相似性,而种间同源物的相似性也大于70%。类群内的同源基因并非平行进化产生的,拟南芥基因组中进化出AtftsH1/5、AtftsH2/8、AtftsH3/10和AtftsH7/9共4个同源基因对,而水稻基因组中只有OsftsH3/8和OsftsH4/5两个同源基因对。每一类群中的成员在基因外显子-内含子边界分布上表现出高度保守性,在蛋白功能结构域的可变残基上具有偏爱性,而内含子在碱基组成和序列长度上表现出广泛的变异。拟南芥和水稻ftsH基因家族的比较分析为其他物种ftsH基因的特...
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| 关 键 词： | ftsH基因 拟南芥 水稻 基因组 系统进化分析 |
| 收稿时间： | 2009/4/18 0:00:00 |
Genome-wide comparative analysis of the metalloprotease ftsH gene families between Arabidopsis thaliana and rice |
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| Jiedao Zhang and Aiqing Sun.Genome-wide comparative analysis of the metalloprotease ftsH gene families between Arabidopsis thaliana and rice[J].Chinese Journal of Biotechnology,2009,25(9):1402-1408. |
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| Authors: | Jiedao Zhang and Aiqing Sun |
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| Abstract: | Filamentation temperature-sensitive H(FtsH) is an ATP-dependent metalloprotease in prokaryotes and eukaryotes.Homology-based analysis was applied to determine 12 ftsH genes in Arabidopsis genome and 9 members in rice genome.Distribution of these ftsH genes on each chromosome displayed a clear preference for some chromosomes such as chromosome 1,2,5 of Arabidopsis and chromosome 1,5 of rice.All 21 FtsH proteins were subcellularly targeted to chloroplast or mitochondria.These members could be phylogenetically... |
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| Keywords: | ftsH gene Arabidopsis thaliana rice genome phylogenetic analysis |
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