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Vorinostat,a possible alternative to metronidazole for the treatment of amebiasis caused by Entamoeba histolytica |
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| Authors: | S Montaño L A Constantino-Jonapa Y Sixto-López V I Hernández-Ramírez A Hernández-Ceruelos L C Romero-Quezada |
| Institution: | 1. Laboratorio de Bioinformática, Facultad de Ciencias Químico-Biológicas, Universidad Autónoma de Sinaloa (FCQB-UAS), Blvd. de las Américas y Josefa Ortiz de Domínguez s/n. Ciudad Universitaria, Culiacán Sinaloa, México;2. Centro de Investigación y de Estudios Avanzados del IPN (CINVESTAV -IPN), Mexico City, México;3. Laboratorio de Modelado Molecular, Bioinformática y Dise?o de Fármacos, Sección de Estudios de Posgrado e Investigación, Escuela Superior de Medicina, Instituto Politécnico Nacional, CDMX, México;4. área Académica de Medicina, Instituto de Ciencias de la Salud, Universidad Autónoma del Estado de Hidalgo, Circuito Ex Hacienda La Concepción S/N Carretera Pachuca-Actopan, San Agustín Tlaxiaca, Hidalgo, México |
| Abstract: | Abbreviations SAHA suberoylanilide hydroxamic acid EhHDAC Histone Deacetylase from Entamoeba histolytica Rg Radius of gyration RMSD root-mean-square deviation RMSF root-mean-square fluctuation MDS molecular dynamics simulation VMD Visual Molecular Dynamics NAMD Nanoscale Molecular Dynamics PBC periodic boundary conditions PME Particle Mesh Ewald 3D three-dimensional Cα alpha carbon FDA Food and Drug Administration ns nanoseconds GPU CUDA Graphics Processing Unit Compute Unified Device Architecture Communicated by Ramaswamy H. Sarma |
| Keywords: | |