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用序列比对设计的茎环结构探针检测金黄色葡萄球菌
作者姓名:杨旭  肖潇  陈章  李会东  邓乐
作者单位:湖南师范大学生命科学学院,长沙,410081
摘    要:基于金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列,采用序列比对设计了一种茎环结构的寡聚核苷酸探针。探针的环序列即为金黄色葡萄球菌16S rRNA基因序列的其中一个片段,同其他菌种的16S rRNA基因序列误配2个以上的核苷酸,因此能高度专一、灵敏的检测金黄色葡萄球菌16S rRNA。根据分子信标技术和酶联免疫分析的原理,评估一个实验方法,即利用能构象转换的、固定化的茎环结构探针酶联检测靶核酸。由于探针的特异性加强,这个检测系统能有效的排除假阳性即不会出现误配一个核苷酸的情况。采用微量浓度测定分析,最低下限可检测出大约4ng的金葡球菌16SrRNA。这种方法的灵敏度比其他常规检测方法高出了至少一个数量级。

关 键 词:序列比对  茎环结构探针  16S核糖体核糖核酸  检测
文章编号:0253-2654(2007)06-1169-05
收稿时间:2006-12-28
修稿时间:2007-06-13
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