| 小桐子EST-SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析 |
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| 引用本文： | 杨春,刘爱忠.小桐子EST-SSR分子标记的开发与种质遗传多样性分析[J].云南植物研究,2011,33(5):529-534. |
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| 作者姓名： | 杨春 刘爱忠 |
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| 作者单位： | 1. 中国科学院西双版纳热带植物园,云南勐腊666303;中国科学院研究生院,北京100049
2. 中国科学院西双版纳热带植物园,云南勐腊,666303 |
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| 摘 要： | 小桐子（Jatrophacurcm）适应性强，不择土壤，种子油脂性能适宜生物柴油的生产，是重要的生物柴油植物。基于小桐子种子发育过程中的EST序列，采用生物信息学方法，从4640个EST非冗余序列上鉴别了1009个SSR位点并分析其分布特征；开发了11对多态的EST—SSR分子标记，并利用这些分子标记调查了24个不同地理种源的遗传多样性，从每个位点的等位基因数目（2—3，平均为2．45）、期望杂合度（He为0．0887—0．5128，平均是0．2736）、多态信息含量（PIC为0．0847～0．4031，平均是0．2313）等方面反映了小桐子种质的遗传多样性低。进一步分析显示不同地理种源的遗传关系缺乏明显的地理结构。作者开发的EST—SSR分子标记不仅有助于小桐子种质的遗传多样性研究，也有助于小桐子种质间的遗传关系鉴别。
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| 关 键 词： | 小桐子 生物柴油植物 EST—SSR 遗传多样性 |
Development of EST-SSR Markers from Jatropha curcas (Euphorbiaceae) and Their Application in Genetic Diversity Analysis among Germplasms |
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| YANG Chun,LIU Ai-Zhong.Development of EST-SSR Markers from Jatropha curcas (Euphorbiaceae) and Their Application in Genetic Diversity Analysis among Germplasms[J].Acta Botanica Yunnanica,2011,33(5):529-534. |
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| Authors: | YANG Chun LIU Ai-Zhong |
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| Institution: | YANG Chun1,2,LIU Ai-Zhong1**(1 Xishuangbanna Tropical Botanical Garden,Chinese Academy of Sciences,Mengla 666303,China,2 Graduate University of Chinese Academy of Sciences,Beijing 100049,China) |
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| Abstract: | Jatropha curcas(Euphorbiaceae) has created tremendous interest all over the world for the use of its seed oil as a commercial source of biodiesel.Based on 9843 ESTs available from the developing seeds of Jatropha curcas,we identified 1009 SSRs in 4640 unigenes and developed 11 polymorphic EST-SSR markers which exhibited a low level of genetic diversity among germplasms,i.e.allele number varied from 2 to 3,with a average of 2.45;Heterozygosity(He) ranged from 0.0887-0.5128,with a average of 0.2736;Polymorphi... |
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| Keywords: | Biodiesel plant EST-SSR Genetic diversity Jatropha curcas |
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