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番茄 SlDP1 基因的克隆、生物信息学及表达特性分析
引用本文:杜利欣;胡宗利;张建苓;陈国平. 番茄 SlDP1 基因的克隆、生物信息学及表达特性分析[J]. 植物研究, 2014, 34(1): 68-74
作者姓名:杜利欣;胡宗利;张建苓;陈国平
作者单位:重庆大学生物工程学院,重庆 400044
摘    要:DP基因属于DP/E2F转录因子家族,其编码的蛋白是E2F蛋白的二聚化分子伴侣,可能参与调控细胞周期、DNA复制、生长、分化、凋亡等多种细胞进程。根据SGN数据库登录的番茄序列,通过RT-PCR方法从野生型番茄中克隆了一个DP基因,命名为SlDP1。生物信息学预测,SlDP1蛋白定位于细胞核,具有保守的DNA结合域、二聚化区域和C-末端及多个磷酸化位点。蛋白质二级结构预测SlDP1蛋白含51.50%的环状结构,34.55%的α螺旋和2.66%的β折叠。荧光定量PCR分析外源激素对野生型番茄SlDP1基因表达量的影响,发现该基因受外源性乙烯前体ACC的诱导。对环境因子应答的RT-PCR结果表明,在伤害和盐处理的叶中该基因表达不受诱导,而盐处理的根中该基因表达量提高。SlDP1基因表达模式分析表明,该基因在根、花、萼片及成熟时期果实中表达量较高。这些结果为进一步研究SlDP1基因在番茄生长发育过程的功能奠定了基础。

关 键 词:SlDP1基因;生物信息学分析研究;表达模式;激素处理;非生物环境胁迫

Cloning,Bioinformatics and Expression Analysis of SlDP1 Gene in Tomato
DU Li-Xin;HU Zong-Li;ZHANG Jian-Ling;CHEN Guo-Ping. Cloning,Bioinformatics and Expression Analysis of SlDP1 Gene in Tomato[J]. Bulletin of Botanical Research, 2014, 34(1): 68-74
Authors:DU Li-Xin;HU Zong-Li;ZHANG Jian-Ling;CHEN Guo-Ping
Affiliation:College of Bioengineering,Chongqing University,Chongqing 400044
Abstract:
Keywords:SlDP1 gene  bioinformatics  expression pattern  hormone  abiotic environment stress
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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