| MiR-21靶基因预测和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 麦秀英,徐柳,李萍. MiR-21靶基因预测和生物信息学分析[J]. 生物学杂志, 2014, 0(6): 89-93 |
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| 作者姓名： | 麦秀英 徐柳 李萍 |
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| 作者单位： | 西南交通大学生命科学与工程学院,成都,610031 |
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| 基金项目： | 教育部留学回国人员科研启动基金（项目号2013S03008） |
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| 摘 要： | 为了利用生物信息学方法预测miR-21的靶基因及其功能,为后续研究miR-21及其靶基因在结肠癌发生中的作用机制奠定基础。研究通过miRBase获取并分析多个物种的miR-21的序列特征;应用Target Scan、Pic Tar,miRanda及miRecords 4种在线工具预测miR-21的靶基因,结合已证实的靶基因,对靶基因进行功能注释和信号通路富集分析;通过查找文献,综述miR-21的功能,结合功能注释和信号通路富集分析为进一步研究mir-21在结肠癌发生中的作用提供理论基础。
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| 关 键 词： | miR-21 靶基因 生物信息学 结肠癌 |
Bioinformatic analysis and prediction of MiR-21 target genes |
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| MAI Xiu-ying,XU Liu,LI Ping. Bioinformatic analysis and prediction of MiR-21 target genes[J]. Journal of Biology, 2014, 0(6): 89-93 |
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| Authors: | MAI Xiu-ying XU Liu LI Ping |
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| Affiliation: | (School of Life Science and Engineering, Southwest Jiaotong University, Chengdu 610031, China) |
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| Abstract: | To predict miR-21 target genes and their functions through bioinformatic analysis and to establish the basis for the study of the mechanism of miR-21 and its target genes in colon cancer,miR-21 target genes were predicted by Target Scan,Pic Tar,miRanda and miRecords. Combined with validated target genes,the genes were analyzed by GO（ gene ontology） and pathway enrichment. |
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| Keywords: | miR-21 target genes bioinformatics colon cancer |
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