| 奥密克戎BA.1变异株在全球的流行和刺突蛋白的进化分析 |
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| 引用本文： | 赵建楠,宋洋,王英,时雨晴,胡宏俏,黄星湖,郭宏,江洁,张燕,许文波.奥密克戎BA.1变异株在全球的流行和刺突蛋白的进化分析[J].病毒学报,2023(3):609-619. |
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| 作者姓名： | 赵建楠 宋洋 王英 时雨晴 胡宏俏 黄星湖 郭宏 江洁 张燕 许文波 |
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| 作者单位： | 1. 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;2. 安徽理工大学医学院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发项目（项目号：2022YFE0202800）,题目：新型冠状病毒通用治疗性多肽疫苗的研究~~； |
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| 摘 要： | 新型冠状病毒Omicron变异株出现之后，在全球暴发流行过程中不断进化出传播速度更快、免疫逃逸能力更强的进化分支，为了探究BA.1变异株在全球暴发流行的特征及刺突蛋白(Spike,S)基因的进化特征，本研究对其全基因序列的全球报告情况和S基因的进化特征进行了分析。本文通过全球共享流感数据倡议组织(Global Initiative of Sharing All Influenza Data,GISAID)获取Omicron BA.1系列变异株的全基因序列信息，分析BA.1系列变异株S基因氨基酸突变并构建系统进化树和进行贝叶斯系统进化分析。本研究提示全球约有1.2亿人被BA.1系列变异株感染，全球提交的BA.1系列变异株序列数在其出现2个月后达到高峰，5个月后占新型冠状病毒的比例下降到4.38%，累计提交BA.1全基因序列最多的区域是欧洲、美洲；截止2022年10月，BA.1系列变异株中序列提交数占绝对优势的是BA.1.1(42.07%)，其次是BA.1(18.81%)。对S基因的氨基酸变异分析显示BA.1有56个进化分支，其中48个分支稳定遗传了Omicron原始株S蛋白中的18个氨基...
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| 关 键 词： | 奥密克戎BA.1 进化分支 刺突蛋白 全球流行 进化分析 |
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