| 2019-2022年南京市急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒分子流行病学分析 |
| |
| 引用本文： | 陶璐秋,王璇,余艳,葛藤,龚红瑾,雍玮,丁洁.2019-2022年南京市急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒分子流行病学分析[J].病毒学报,2023(5):1272-1284. |
| |
| 作者姓名： | 陶璐秋 王璇 余艳 葛藤 龚红瑾 雍玮 丁洁 |
| |
| 作者单位： | 1. 南京医科大学附属南京疾病预防控制中心;2. 南京医科大学公共卫生学院 |
| |
| 基金项目： | 江苏省卫生健康委医学科研立项项目（项目号：H2019019）,题目：诺如病毒深度测序与分子溯源技术研究及应用~~； |
| |
| 摘 要： | 诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一，本研究通过分析2019-2022年南京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的流行特征和主要基因型变化，为疫情防控提供依据。收集2019年9月至2022年8月南京市疑似诺如病毒急性胃肠炎暴发样本，通过荧光定量PCR和一步法RT-PCR检测，对阳性样本进行序列测定并分型，挑选48株南京代表株与国内外参考株进行同源性分析。2019-2022年南京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的高峰为冬春季，场所主要分布在小学和幼儿园，暴发以诺如病毒GII为主，共检测到11种基因型，包括4种GI和7种GII。主要流行株在三个流行季间有所变化，GII.2P16]为2019-2021年的优势流行株，2021/2022流行季中GII.4 Sydney 2012P16]亚型、GII.17P17]亚型占比最大，多种亚型毒株共存。同源分析发现，2021年2株GII.6P7]南京株分属于两类不同来源的GII.6衣壳基因型，2019-2022年的GII.2P16]和GII.4 Sydney 2012P16]南京株的部分聚合酶区序列变化较衣壳蛋白区大。2019-2022年间南京市诺如病毒急性...
|
| 关 键 词： | 诺如病毒 暴发 急性胃肠炎 基因型 |
|
|
