| SARS-CoV-2 Omicron变异株荧光定量PCR鉴别方法的建立及应用 |
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| 引用本文： | 牛培华,何雅青,李晓燕,马红霞,朱琳,郑宝璐,魏欣仪,李诗敏,朱灿,卢清菊,孟君,彭博,王佶,马学军.SARS-CoV-2 Omicron变异株荧光定量PCR鉴别方法的建立及应用[J].病毒学报,2023(1):1-5. |
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| 作者姓名： | 牛培华 何雅青 李晓燕 马红霞 朱琳 郑宝璐 魏欣仪 李诗敏 朱灿 卢清菊 孟君 彭博 王佶 马学军 |
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| 作者单位： | 1. 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所国家卫生健康委员会医学病毒和病毒病重点实验室;2. 深圳市疾病预防控制中心病原生物研究所;3. 天津市疾病预防控制中心病原生物检测室;4. 河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所;5. 中国疾病预防控制中心中国现场流行病学培训项目 |
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| 摘 要： | 开发和评价一种用于鉴别Omicron变异株的荧光定量PCR方法。我们针对Omicron变异株S基因的两个特异性突变位点开发了一种基于荧光定量PCR的Omicron变异株分型方法（Omicron RT-qPCR）。通过测试临床样本来评价方法的特异性，通过标准品评价方法的灵敏度。Omicron RT-qPCR分型方法显示能够可靠地区分Omicron变异株和“野生型” SARS-CoV-2及Alpha、Beta、Delta变异株及甲型流感病毒。选取68例新冠疑似样本，全基因组测序（Whole genome sequencing,WGS）结果显示44例为Omicron变异株，Omicron RT-qPCR分型结果均为阳性；11例为Delta变异株，Omicron RT-qPCR分型结果均为阴性；另外，通过WGS分析未能成功分型的7例样本，通过Omicron RT-qPCR分型方法成功鉴定为Omicron BA.1和BA.2变异株。我们开发的Omicron RT-qPCR分型方法可以在普通的PCR检测实验室应用，为我国疾控系统和医疗机构及时监测SARS-CoV-2 Omicron变异株的传播提供...
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| 关 键 词： | SARS-CoV-2 Omicron变异株 基因分型 检测方法 |
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