| 资阳香橙砧木CjSPL基因家族鉴定及表达模式分析 |
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| 引用本文： | 彭洪娴,邱洁雅,惠秋玲,徐媛媛,淳长品,凌丽俐,曹立,何义仲,彭良志,付行政.资阳香橙砧木CjSPL基因家族鉴定及表达模式分析[J].生物工程学报,2023,39(2):625-639. |
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| 作者姓名： | 彭洪娴 邱洁雅 惠秋玲 徐媛媛 淳长品 凌丽俐 曹立 何义仲 彭良志 付行政 |
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| 作者单位： | 西南大学柑桔研究所 国家柑桔工程技术研究中心, 重庆 400712 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（32072550）；国家重点研发计划（2018YFD1000300）；国家现代农业（柑橘）产业技术体系建设专项（CARS-26） |
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| 摘 要： | 鳞片启动子结合类蛋白(squamosa promoter binding protein-like,SPL)家族是一类参与调控植物生长发育以及响应环境胁迫的重要转录因子,但在柑橘等多年生果树中的研究较少。本研究以柑橘一种重要的砧木——资阳香橙(Citrus junos Sieb.ex Tanaka)为材料,基于plantTFDB转录因子数据库和甜橙基因组数据库鉴定并克隆出资阳香橙15个SPL家族基因,命名为CjSPL1–CjSPL15。序列分析表明,CjSPLs的开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为393–2865 bp,编码130–954个氨基酸;系统进化树将15个CjSPLs分为9个亚家族;基因结构和保守结构域分析预测出20个不同的保守motif和SBP基本结构域;启动子顺式作用元件分析预测出20种启动子元件,其中包含植物生长发育、非生物胁迫及次生代谢物相关元件。通过实时荧光定量PCR(real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)分析了CjSPLs在干旱、盐和低温胁迫下的表达模式,较多CjSPLs在胁迫处理后显著上调表达。本研究为后续深入研究柑橘及其他果树SPL家族转录因子功能提供参考。
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| 关 键 词： | 资阳香橙 SPL基因家族 非生物胁迫 表达模式 |
| 收稿时间： | 2022/8/23 0:00:00 |
Identification of CjSPL gene family in Ziyang Xiangcheng rootstock and expression pattern analysis |
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| PENG Hongxian,QIU Jiey,HUI Qiuling,XU Yuanyuan,CHUN Changpin,LING Lili,CAO Li,HE Yizhong,PENG Liangzhi,FU Xingzheng.Identification of CjSPL gene family in Ziyang Xiangcheng rootstock and expression pattern analysis[J].Chinese Journal of Biotechnology,2023,39(2):625-639. |
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| Authors: | PENG Hongxian QIU Jiey HUI Qiuling XU Yuanyuan CHUN Changpin LING Lili CAO Li HE Yizhong PENG Liangzhi FU Xingzheng |
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| Institution: | National Citrus Engineering Research Center, Citrus Research Institute, Southwest University, Chongqing 400712, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Ziyang Xiangcheng SPL gene family abiotic stress expression pattern |
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