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大白菜NHX基因家族的鉴定与表达分析
作者姓名:王雪花  韩佳  马济中  杨曦婷  满华丽  乔亚丽  高雪琴  胡琳莉
作者单位:甘肃农业大学园艺学院, 甘肃 兰州 730070
基金项目:甘肃农业大学省级大学生创新创业训练计划项目(S202010733085);甘肃农业大学学生大学生创新创业计划(202012007);甘肃省高等学校创新基金项目(2021A-058)
摘    要:Na+/H+逆向转运蛋白(Na+/H+antiporter,NHX)基因家族在植物响应盐胁迫中发挥重要作用。本研究鉴定了大白菜NHX基因家族成员,并分析了大白菜NHX基因(Brassica rapa ssp.Pekinensis NHX,BrNHXs)响应高温、低温、干旱和盐胁迫等非生物逆境的表达模式。结果表明,在大白菜中共鉴定到9个NHX基因家族成员,分布在大白菜的6条染色体上,其氨基酸数目在513–1154 aa之间,相对分子量集中在56804.22–127856.66 kDa,等电点位于5.35–7.68之间。该基因家族成员主要存在于液泡中,基因结构完整,外显子的数目介于11–22之间。大白菜NHX基因家族编码的蛋白质二级结构都具有α-螺旋、β-转角和不规则卷曲结构,其中α-螺旋发生频率较高。实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析显示,该基因家族成员在高温、低温、干旱和盐胁迫下均有不同程度地响应,且在不同时间表达差异显著。以BrNHX02和BrNHX09对这4种胁迫的响应最为显著,表达量在处理72 h时均显著上调,可作为候选基因进一步验证其功能。

关 键 词:NHX基因家族  亚细胞定位  荧光定量  胁迫  大白菜
收稿时间:2022-08-05
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