基于转录组学的蓖麻耐盐基因的挖掘

为获取蓖麻耐盐基因的序列信息，挖掘盐胁迫下差异表达基因及相关代谢途径，本研究以盐胁迫（300 mmol/L NaCl）处理0、12和24 h后通篦5号的幼苗真叶为试验材料，借助高通量测序技术进行转录组测序分析。结果表明，在盐胁迫12 h和24 h分别有4822和3103个差异表达基因。对共有的1872个差异表达基因进行共表达模式聚类分析，发现这些基因共有3种表达模式。KEGG代谢通路分析结果显示，缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解（ko00280）、植物昼夜节律调控（ko04712）以及淀粉和蔗糖代谢（ko00500）3个通路在盐胁迫适应过程中显著富集；GO功能富集分析结果显示，多数差异表达基因被富集到生物过程中，其中细胞进程（GO:0009987）和响应非生物胁迫（GO:0009628）过程富集到差异表达基因的数目最多。另外，共有19个转录因子参与蓖麻的盐胁迫响应。植物激素信号转导通路中有42个差异表达基因，其中有97.6%的基因分别在12 h和24 h是上调表达的。此外，还筛选出包括光合作用途径、抗氧化调节、Na+、K+和Ca2+转运相关参与蓖麻幼苗盐胁迫的差异表达基因。qRT-PCR结...