| H3N2亚型人流行性感冒病毒HA1的蛋白序列同源性比较、变异规律及结构与功能的分析 |
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| 引用本文： | 王勇,薛颖,陈淑霞,金奇,侯云德. H3N2亚型人流行性感冒病毒HA1的蛋白序列同源性比较、变异规律及结构与功能的分析[J]. 病毒学报, 2002, 18(4): 289-296. DOI: 10.3321/j.issn:1000-8721.2002.04.001 |
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| 作者姓名： | 王勇 薛颖 陈淑霞 金奇 侯云德 |
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| 作者单位： | 中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,病毒基因工程国家重点实验室,北京,100052;中国疾病预防控制中心,营养与食品安全所,北京,100050;中国疾病预防控制中心,病毒病预防控制所,病毒基因工程国家重点实验室,北京,100052 |
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| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划);; |
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| 摘 要： | 应用生物信息学数据库和工具,结合自身的实验结果,对现有的H3N2亚型人流行性感冒(流感)病毒全球分离株的HA1氨基酸序列和蛋白分子结构进行了分析研究.初步的进化分析结果表明,历史上的分离株大致分为以年代划分为特征的两大谱系,即1968～1984/1985年的谱系,时间跨度为18年;1984/1985～1997/2000年的谱系,时间跨度为13～17年.它们分别起源于两类毒株,并在各自的谱系内发展演化,基本上不存在大规模相互交叉渗透的现象.在1984/1985年,两大谱系发生交替转换和过渡,说明流感病毒的起源、发展和演化是有一定规律性的,这可能对流感的监测预报有一定的指导意义.绝大多数毒株的二硫键组成位点和糖基化位点是极其保守的.受体结合位点(RBS)的一部分构成成份保守;其他构成成份发生变异甚至高变,并与某些抗原决定簇位点重合,可能参与了抗原抗体相互作用.5个抗原决定簇位点的变异各有其特点.A和B位点的变异表现最活跃,抗原性最强,但B位点稍弱于A位点.C和D位点的抗原性一般,且D位点的变异性低于C位点.E位点抗原性一般.在各位置的变异中,大多常是相同相近性质或相同种类的氨基酸相互替换.HA1蛋白全序列的熵(entropy)峰值作图的分析表明,HA1蛋白上121～126位等区域或位点可能独立,或参与构成了某些已知或未知的抗原决定簇位点.这很可能是新发现的或未被鉴定的抗原决定簇位点或其组成.
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| 关 键 词： | 流行性感冒病毒 HA1氨基酸序列 结构与功能 生物信息学 |
| 文章编号： | 1000-8721(2002)04-0289-08 |
Analysis and Studies on the Amino Acid Sequence Homology,Mutant Regularity,Structural and Functional Relationship of HA1 of Human Influenza Virus(H3N2) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | influenza virus HA_1 amino acid sequence structure and function bioinformatics |
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