首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     

家族性双侧大结节性肾上腺增生症生物标志物的生信分析
作者姓名:汤鑫  朱焱  沈毅  司晓云  何万娅  聂颖
作者单位:贵州医科大学 公共卫生与健康学院,贵阳550025;贵州医科大学附属医院 心内科,贵阳 550004[HJ
基金项目:贵阳市科技计划项目(No.[2019]9-1-34);
摘    要:
为寻找与家族性双侧大结节性肾上腺皮质增生症发展有关的潜在治疗靶点和生物标志物。从GEO数据库中下载GSE171558数据集,筛选受家族影响的肾上腺结节与正常的肾上腺组织之间的差异表达基因(Differentially expressed genes, DEGs),并进行基因功能富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析。通过Cytoscape v3.9.1软件中的插件cytoHubba筛选出关键基因,进一步经NetworkAnalyst分析TF-miRNA共调控网络和蛋白质-化合物相互作用。共鉴定出336个DEGs,这些基因主要富集在细胞粘附过程、细胞增殖的正调节过程和RNA加工过程等生物过程,并涉及钙信号通路、PI3K-Akt信号通路和cAMP信号通路等。通过cytoHubba插件获得5个hub基因,经验证分析,多功能蛋白聚糖(Versican,VCAN)、双糖链蛋白聚糖(Biglycan,BGN)被认为是家族性双侧大结节性肾上腺皮质增生症的潜在生物标志物。进一步的GSEA分析结果显示,VCAN主要与丁酸代谢、ECM-受体相互作用和类固醇生物合成等有关。BGN主要涉及剪接体、皮质醇的合...

关 键 词:生物信息学  双侧大结节性肾上腺皮质增生症  差异表达基因
收稿时间:2022-10-09
修稿时间:2022-11-15
点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息
点击此处可从《生物信息学》下载全文
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号