| 斑马鱼急性无机砷暴露后肝脏差异表达基因的生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | 张新生 张越 孙纳 |
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| 作者单位： | 无锡市疾病预防控制中心 职业与放射卫生科,江苏,无锡 214000;沈阳医学院 职业卫生科, 沈阳 110000 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(No.81070128);沈阳市“高层次创新人才计划”项目(No.RC170408);沈阳医学院硕士研究生科研创新基金项目(No.Y20190501);辽宁省重点研发计划项目(No.2018225013);沈阳中青年高层次人才创新支持计划项目(No.RC180379). |
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| 摘 要： | 
砷是一种致癌物,是心血管、外周血管疾病、神经疾病、糖尿病和各种癌症的致病因素。目的:利用GO数据库和KEGG数据库等生物信息学方法对GEO数据库数据中的差异表达基因进行评价。利用生物信息学分析软件对差异基因进行功能富集、功能注释分析和生存分析。利用Cytoscape上的蛋白-蛋白相互作用网络(Protein-protein interaction network, PPI)软件对179个差异基因进行筛选和分析。结果发现126个基因作用于蛋白靶点,其中有10个基因为关键基因分别为:PSMB3、HSP701、HSPE1、STIP1、HSPD1、HSP70、DNAJB1B、HSP90AA1.1、HSPA9H和TCP1。核心基因主要作用于内质网中的蛋白质加工通路。这可能会为砷对肝脏损伤的潜在生物标志物和生物学机制提供新的思路。
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| 关 键 词： | 生物信息学 微阵列 砷 差异表达基因 |
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