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浙江乐清铁皮石斛rDNA ITS序列的克隆及序列比对
引用本文:周倩,蒋贤慧,杨晶晶,高必达. 浙江乐清铁皮石斛rDNA ITS序列的克隆及序列比对[J]. 基因组学与应用生物学, 2010, 29(3). DOI: 10.3969/gab.029.000513
作者姓名:周倩  蒋贤慧  杨晶晶  高必达
作者单位:1. 湖南农业大学生物安全科学技术学院,长沙,410128;植物疾病与利用湖南省高校重点实验室,长沙,410128
2. 湖南农业大学生物安全科学技术学院,长沙,410128
基金项目:湖南省大学生研究性学习和创新性实验计划项目 
摘    要:
为判断浙江乐清铁皮石斛(Zhejiang Dendrobium officinale)与石斛属(Dendrobium)其它物种的亲缘关系,本文提取了该石斛鲜样的DNA,利用真核生物ITS序列通用引物ITS4/ITS5进行了扩增,并将扩增产物连接转化至大肠杆菌,在对阳性克隆测序。将得到的序列与GenBank上我国石斛属12个组中34个种的rDNAITS进行了比对,并在此基础上构建了系统发育树。序列比对结果表明浙江乐清铁皮石斛的rDNAITS与黄石斛(D.tosaense)一致,其次与铁皮石斛(D.officinale)最相近,序列相似性99%。系统发育树也表明浙江乐清铁皮石斛的rDNAITS序列与黄石斛(D.tosaense)的相似程度高于其与铁皮石斛(D.officinale)的相似程度。本研究将为利用ITS序列鉴别石斛物种种属关系提供参考。

关 键 词:铁皮石斛  克隆  序列比对

Cloning and Sequence Alignment of rDNA ITS Sequences of Dendrobium officinale Cultivated in Zhejiang Province
Zhou Qian,Jiang Xianhui,Yang Jingjing,Gao Bida. Cloning and Sequence Alignment of rDNA ITS Sequences of Dendrobium officinale Cultivated in Zhejiang Province[J]. Genomics and Applied Biology, 2010, 29(3). DOI: 10.3969/gab.029.000513
Authors:Zhou Qian  Jiang Xianhui  Yang Jingjing  Gao Bida
Abstract:
Keywords:rDNA ITS  PCR
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