我国中部HIV-1B’亚型分离株基因组结构特征及系统发育分析

为了分析河南省Human immunodeficiency virus—I(HIV-1)流行株的基因特征和传染来源，我们从一位HIV-1感染的有偿献血员体内分离HIV-1毒株。提取感染细胞的全基因组DNA，扩增病毒全基因组，Walking法测得全长序列。与HIV-1RL42和HIV-1HXB2株比较，分析基因特征。用Anthewin软件比较分析CNHN24株和RL42株env蛋白的二级结构。用Clustal软件对国内HIV-1分离株和国际参考株的全基因组、env基因和订环基因分别进行了系统发育分析。结果发现，CNHN24株为HIV-1B’亚型，富含嘌呤，含量达到60．26％。与RL42株及HXB2株比较，pol基因和gag基因变异度较小，env基因及非结构基因变异度较大。与RL42株相比，env蛋白二级结构变异不大，但env保守区C4的氨基酸呈高度变异。系统发育分析显示，CNHN24株与RL42株遗传距离最近，HIV-1Lai株和HXB2株次之，与国内的H1V-1B／C及AE／BC重组毒株的遗传距离较远；从份序列的比较可以发现，CNHN24株与来自云南省的毒株HIV-1CR206及RL42遗传距离最近。认为HIV-1CNHN24株可能由云南传入。