解淀粉芽孢杆菌Q426双组分信号转导系统的生物信息学分析 |
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引用本文: | 师舷,刘佳璐,董极靓,吴亚多,权春善.解淀粉芽孢杆菌Q426双组分信号转导系统的生物信息学分析[J].生物技术,2019(4). |
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作者姓名: | 师舷 刘佳璐 董极靓 吴亚多 权春善 |
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作者单位: | 大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室 |
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摘 要: | 目的]分析解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)双组分信号转导系统(Two-Component Signal Transduction System,TCS)的结构、功能和分布,为挖掘解淀粉芽孢杆菌的生物功能、开发其商业价值提供理论依据。方法]采用生物信息学方法,系统分析了由笔者实验室分离得到并完成全基因组测序的解淀粉芽孢杆菌Q426的TCS。结果]Q426菌株所携带的HKs和RRs分别为42和40,其中成对的TCS(HK-RR)数为19,杂合的TCS(Hybrid)为1,而HKs和RRs分别为22和20,并对19对TCS中15对的生物学功能做出预测。结论]Q426菌株的TCS涉及杆菌肽、羊毛硫抗生素和多种抗菌肽的合成,为深入研究解淀粉芽孢杆菌抗菌活性物质的合成与调控提供思路。
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