IBV青岛腺胃分离株(SD/97/02)S1蛋白基因的序列测定和分析 |
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引用本文: | 潘杰彦,陈德胜,戴亚斌,陈溥言. IBV青岛腺胃分离株(SD/97/02)S1蛋白基因的序列测定和分析[J]. 中国病毒学, 2001, 16(4): 377-381 |
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作者姓名: | 潘杰彦 陈德胜 戴亚斌 陈溥言 |
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作者单位: | 潘杰彦(南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏南京210095) 陈德胜(南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏南京210095) 戴亚斌(南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏南京210095) 陈溥言(南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏南京210095) |
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基金项目: | 国家自然科学基金重大项目(39893290 2-2) |
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摘 要: | ![]() 参考Genbank上发表的IBV S1纤突蛋白基因序列,设计了一对引物,对鸡传染性支气管炎病毒青岛腺胃分离株(SD/97/02)RNA进行RT-PCR扩增.将PCR产物克隆入pMD18-T载体中进行序列测定和分析.序列分析表明,该毒株的S1基因的G+C%含量较少,为37.0%,存在HindⅢ,BamHI,BgIII,SacI和SalI位点,无EcoRI位点,与其他毒株的同源性在87.02%-94.21%之间,在第154~429nt处为高度的变异区;将基因序列翻译成氨基酸后,假定的S1蛋白由540个氨基酸组成,等电点8.24,在蛋白质内部存在18个Cys,在S1与S2蛋白之间的剪切位点为HRRRR,这与大多数IBV毒株(RRF/SRR)不一样,有三个区域的氨基酸序列高度保守;169~181aa,230~250aa,485~506aa;与其他毒株进行抗原性比较后发现,在该毒株的320~326aa及390~401aa处的抗原表位消失,而在325~345aa、379~389aa处则出现了很强的抗原表位;第438~444aa处,其他IBV毒株(除ZJ971株外)原来存在的强抗原位点在本毒株中消失;在53~65位的氨基酸抗原性与其他毒株相比明显变弱.
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关 键 词: | IBV 腺胃株 S1纤突蛋白基因 序列分析 |
文章编号: | 1003-5125(2001)04-0377-05 |
修稿时间: | 2001-03-08 |
Sequencing and Sequence Analysis of S1 Spike Protein Gene from Avian Infectious Bronchitis Virus Proventriculus Strain Isolated in Qingdao(SD/97/02) |
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Abstract: | ![]()
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