| 基于PDB数据库的三个RNA二级结构预测软件评估 |
| |
| 作者姓名： | 刘伟 黄伊子 李都悦 向妍 周玮 |
| |
| 作者单位： | 湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室, 长沙 410128 ;湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心, 长沙 410128,湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室, 长沙 410128 ;湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心, 长沙 410128,湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室, 长沙 410128 ;湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心, 长沙 410128,湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室, 长沙 410128 ;湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心, 长沙 410128,湖南农业大学植物保护学院植物病虫害生物学与防控湖南省重点实验室, 长沙 410128 ;湖南省烟草公司郴州市公司, 湖南 郴州 423000 ;湖南农业大学湖南省生物农药与制剂加工工程技术研究中心, 长沙 410128 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金青年项目(31301388);中国博士后面上项目(2014M562109);湖南省自然科学基金(14JJ3092);湖南省科学技术厅科技计划项目(2014GK3046);湖南农业大学大学生科技创新基金(团委)资助科研项目(18);湖南农业大学植物保护学院"大学生创新性实验计划项目(SAY1106)。 |
| |
| 摘 要： | 随着21世纪分子生物学研究的蓬勃发展,RNA二级结构预测成为其中一项重要内容。由于RNA二级结构预测的准确性最为关键,因此寻找高精度且易操作的二级结构预测工具显得非常重要。本文选取三种简单且易操作的二级结构预测软件,先基于PDB数据库收录的318个RNA发夹序列进行二级结构预测,进而通过比较预测结果与实验测定结果进行软件预测性能评估。比较结果显示,RNAstructure为三个软件中性能最优的RNA二级结构预测软件。
|
| 关 键 词： | RNA二级结构 PDB数据库 二级结构预测 准确性 |
| 收稿时间： | 2014-09-15 |
| 修稿时间： | 2014-11-26 |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《生物信息学》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《生物信息学》下载全文 |
|
