| 豌豆蚜基因组P450基因家族的分析 |
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| 引用本文： | 张云华,王强,刘静,张鹏飞,陈建群.豌豆蚜基因组P450基因家族的分析[J].昆虫学报,2010,53(8):849-856. |
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| 作者姓名： | 张云华 王强 刘静 张鹏飞 陈建群 |
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| 作者单位： | 1. 安徽农业大学生命科学学院,合肥,230036;南京大学生命科学学院,南京,210093
2. 南京大学生命科学学院,南京,210093 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，安徽高校省级自然科学研究重点项目，安徽农业大学资助引进与稳定人才项目 |
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| 摘 要： | 细胞色素P450在各种内源和外源物质代谢中起着非常重要的作用。利用豌豆蚜Acyrthosiphon pisum基因组mRNA和氨基酸数据库研究P450基因功能的进化规律。通过生物信息学方法对豌豆蚜全基因组P450进行分析, 结果显示: 在豌豆蚜基因组中发现69个P450基因, 它们分别属于13个P450家族和18个亚家族, 是一个典型的多基因家族。进一步将这些基因与豌豆蚜ESTs数据库进行了比对分析, 其中39个候选基因有EST证据, 证明了这些P450基因在转录水平的真实性。以氨基酸相似度大于60%为标准对豌豆蚜基因组中P450基因进行分组, 69个P450基因中, 除18个基因序列因差异太大, 不能被归入任何一组, 其余51个可归入10个组, 其中8个组(包含47条序列)适合于正选择和基因转换分析。正选择和基因转换分析结果表明: 仅有1个组(含9个基因)显著受到正选择压力作用, 正选择概率大于95%的氨基酸位点分别是20T和27N, 20T位于底物识别位点SRS1, 27N位于D. helix; 有3个组(包含8个基因）显示显著的基因转换事件。 参与基因转换的基因均为CYP4家族成员, 分别是CYP4C, CYP4G和CYP4V亚家族。 参与基因转换的成员之间的蛋白相似度较高（70％~95％）, 且XM_001944991与XM_001951794同存在于SCAFFOLD12542上, XM_001945510与XM_001944057同存在于SCAFFOLD7010上。这可能暗示豌豆蚜P450基因通过基因复制, 然后通过基因转换使P450获得新的功能, 以适应多变的生存环境。此外, 鉴定出20个不同的基序, 其中有5条基序在90％以上的基因中出现。
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| 关 键 词： | 豌豆蚜 细胞色素P450 表达序列标签 正选择 基因转换 基序 |
A genome-wide analysis of P450 gene families in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea) |
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| ZHANG Yun-Hua,WANG Qiang,LIU Jing,ZHANG Peng-Fei,CHEN Jian-Qu.A genome-wide analysis of P450 gene families in the pea aphid, Acyrthosiphon pisum (Hemiptera: Aphidoidea)[J].Acta Entomologica Sinica,2010,53(8):849-856. |
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| Authors: | ZHANG Yun-Hua WANG Qiang LIU Jing ZHANG Peng-Fei CHEN Jian-Qu |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Acyrthosiphon pisum P450 expression sequence tag (EST) positive selection gene conversion motif |
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