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尼罗鳄MHCⅡ类B基因第二外元的序列变异分析
引用本文:李恩,晏鹏,吴孝兵.尼罗鳄MHCⅡ类B基因第二外元的序列变异分析[J].激光生物学报,2010,19(6):804-808.
作者姓名:李恩  晏鹏  吴孝兵
作者单位:安徽师范大学生命科学学院,安徽芜湖241000
基金项目:国家自然科学基金项目,安徽省优秀青年基金项目,重要生物资源保护与利用研究安徽省重点实验室基金项目
摘    要:利用一对简并引物扩增了尼罗鳄MHCⅡ类分子B基因第二外元的部分片段,并对PCR产物进行了克隆和测序,结果得到8种不同的序列,序列长度为166 bp;经分析,序列中有56个变异位点,核苷酸的非同义替换多于同义替换,造成30个位点氨基酸的改变,氨基酸的替换趋于集中在假定的抗原结合位点附近.核苷酸和氨基酸序列与已报道的扬子鳄和密河鳄的MHCⅡ类B基因第二外元序列有较高的同源性,利用PAUP4.0软件构建的NJ树显示,鳄类的MHCⅡ类B基因存在跨种多态性现象.

关 键 词:尼罗鳄  MHCⅡ类B基因第二外元  跨种多态性
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