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广东麻鸭DHBV全基因克隆及新读码框的发现
引用本文:何金洋,葛文华,朱宇同,郭兴伯,杨瑞仪,冯丽玲,张奉学,陈鸿珊.广东麻鸭DHBV全基因克隆及新读码框的发现[J].中国病毒学,2005,20(4):399-403.
作者姓名:何金洋  葛文华  朱宇同  郭兴伯  杨瑞仪  冯丽玲  张奉学  陈鸿珊
作者单位:1. 广州中医药大学热带医学研究所,广东,广州,510405
2. 广州中医药大学温病学教研室,广东,广州,510405
3. 中国医学科学院医学生物技术研究所,北京,100050
摘    要:选取3份DHBV阳性广东麻鸭血清提取DHBV DNA,设计一对扩增DHBV全基因序列引物Q1和Q2,扩增并克隆DHBV全基因序列,测序并运用相关计算机软件及方法分析获得的全基因序列.结果表明,广东麻鸭DH-BV全长为3027bp.提交GenBank后获得的收录号分别为AY433937、AY521226、AY521227(来自1号血清);AY392760、AY536371(分别来自2、3号血清).AY521227的PreS/S ORF出现了单碱基突变,在PreC/CORF之前发现一个新的ORF,暂命名为HORF,HORF也同时存在于GenBank中储存的另外8个DHBV全基因序列中.系统发育分析表明,广东麻鸭DHBV在分化程度上是目前储存于GenBank中的DHBV全序列中最高的.成功克隆了广东麻鸭DHBV全基因序列,序列分析为进一步研究广东麻鸭DHBV提供了有益的信息.

关 键 词:鸭乙肝病毒(DHBV)  全基因序列  克隆  读码框
文章编号:1003-5125(2005)04-0399-05
修稿时间:2004年12月20

Cloning of DHBV Complete Genome from Guangdong Brown Ducks and Finding of a New ORF
HE Jin-yang,GE Wen-hua,ZHU Yu-tong,GUO Xing-bo,YANG Rui-yi,FENG Li-ling,ZHANG Feng-xue,CHEN Hong-shan.Cloning of DHBV Complete Genome from Guangdong Brown Ducks and Finding of a New ORF[J].Virologica Sinica,2005,20(4):399-403.
Authors:HE Jin-yang  GE Wen-hua  ZHU Yu-tong  GUO Xing-bo  YANG Rui-yi  FENG Li-ling  ZHANG Feng-xue  CHEN Hong-shan
Abstract:
Keywords:Duck hepatitis B virus(DHBV)  Complete genome sequence  Clone  Open reading frame  
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