丹参转录因子SmMYB7的克隆及表达模式分析 |
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引用本文: | 朱小亚,崔璀,周宏骏,武玉翠,王喆之.丹参转录因子SmMYB7的克隆及表达模式分析[J].基因组学与应用生物学,2015(2):365-372. |
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作者姓名: | 朱小亚 崔璀 周宏骏 武玉翠 王喆之 |
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作者单位: | 药用资源与天然药物化学教育部重点实验室,西北濒危药材资源开发国家工程实验室,陕西师范大学生命科学学院 |
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摘 要: | 分析丹参转录组数据库(SRX021907),得到一条R2R3-MYB基因,blast比对发现该基因为丹参Sm MYB7(KF059361.1)。分别从g DNA和c DNA水平克隆该基因全长,测序结果表明该基因与公布序列一致,分析发现该基因无内含子序列,包含一个长为954 bp的开放读码框(ORF),编码317个氨基酸残基。多重序列比对和系统进化树分析显示Sm MYB7蛋白与拟南芥At MYB73同属R2R3-MYB第22个亚家族。已有丹参基因信息结合BD walking获得1 974 bp的启动子序列,分析结果表明多种顺式作用元件存在于该基因的启动子区。实时荧光定量PCR分析显示,该基因的表达为组成型,在丹参根、茎、叶、花中都表达;随着花的发育,该基因的表达量逐渐增加;此外,Sm MYB7在盐胁迫、水杨酸、茉莉酸甲酯和脱落酸处理下表达均上调,推测该基因参与调控植物防御和花的发育。
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关 键 词: | 丹参 SmMYB7 生物信息学分析 表达模式分析 |
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