| 临床宏基因组学应用现状及存在问题分析 |
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| 引用本文： | 邱薇,钟民涛,伦永志.临床宏基因组学应用现状及存在问题分析[J].中国微生态学杂志,2021,33(5):594-598. |
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| 作者姓名： | 邱薇 钟民涛 伦永志 |
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| 作者单位： | 莆田学院药学与医学技术学院医学微生态学福建省高校重点实验室,福建 莆田 351100;大连医科大学基础医学院微生物学教研室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2017YFC1103603)；云南省中医药学分子生物学重点实验室(2019DG016) |
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| 摘 要： | 众所周知,宏基因组学是一种通过提取样品中微生物的总DNA,构建宏基因组文库,研究环境中全部微生物的遗传组成及其菌落功能的方法。而宏基因组新一代测序(metagenome next-generation sequencing, mNGS)是在宏基因组学基础上进一步发展起来的新一代测序技术,无需对患者标本进行培养,直接分析标本中的微生物DNA或RNA。本文介绍了宏基因组学在临床上的应用,包括传染病的诊断、疾病和健康状态下的微生物组分析、人类宿主反应分析和肿瘤相关病毒及其基因组鉴定,并简要探讨了临床宏基因组学研究中所遇到的挑战及解决方法。
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| 关 键 词： | 临床微生物学 宏基因组学 传染病诊断 生物信息学 |
Analysis of application and existing problems of clinical metagenomics |
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| QIU Wei,ZHONG Min tao,LUN Yong zhi.Analysis of application and existing problems of clinical metagenomics[J].Chinese Journal of Microecology,2021,33(5):594-598. |
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| Authors: | QIU Wei ZHONG Min tao LUN Yong zhi |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Clinical microbiology Metagenomics Infectious disease diagnosis Bioinformatics |
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