| 人类肠道菌群DNA提取影响因素的研究 |
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| 引用本文： | 吴倩倩,王劲松,李湘鸣.人类肠道菌群DNA提取影响因素的研究[J].中国微生态学杂志,2016(3). |
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| 作者姓名： | 吴倩倩 王劲松 李湘鸣 |
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| 作者单位： | 扬州大学医学院 临床流行病学研究中心,扬州大学医学院 临床流行病学研究中心,扬州大学医学院 临床流行病学研究中心 |
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| 摘 要： | 目的研究提取人类粪便中细菌基因组DNA的影响因素。方法采用溶菌酶和十二烷基磺酸钠(SDS)+石英砂+酚-氯仿抽提法提取粪便标本中细菌DNA,用PCR扩增细菌16SrDNA。比较不同粪便量,不同放置时间,不同放置温度下的粪便细菌DNA浓度及纯度改变;用Chao index评测高通量测序的结果。结果采用20mg粪便量提取出的细菌DNA的浓度最高;常温下放置3h后,提取的细菌DNA的浓度开始下降;在-20℃放置12h后,细菌DNA的浓度开始下降;-70℃放置48h后细菌DNA的浓度开始下降;样品纯度均在1.8以上;Chao index曲线趋于平缓表明测序数据量足够大。结论提取肠道细菌基因组DNA时,粪便标本取样量以20mg为宜,常温下粪便标本放置不超过2h,本研究所使用的方法所提取的DNA浓度可以达到高通量测序的样本要求。
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| 关 键 词： | 人 粪便 细菌基因组 DNA提取 影响因素 |
The impact factors of DNA extraction from human intestinal flora |
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