象甲科线粒体基因组特征及系统发育分析 |
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引用本文: | 陈英,罗朝兵,李沅秋,杨瑶君.象甲科线粒体基因组特征及系统发育分析[J].环境昆虫学报,2019,41(6). |
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作者姓名: | 陈英 罗朝兵 李沅秋 杨瑶君 |
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作者单位: | 西华大学食品与生物工程学院, 成都610000;乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室, 四川乐山614000;乐山师范学院竹类病虫防控与资源开发四川省重点实验室,四川乐山,614000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;四川省科技计划 |
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摘 要: | 昆虫线粒体基因组广泛应用于系统发育关系的重新建立、分子进化、谱系地理学及物种诊断等领域。为揭示象甲科昆虫线粒体全基因组序列的主要结构特征,探究其系统发育相关信息,为进化遗传学研究和分子标记选取等提供参考依据,本研究利用比较基因组学和生物信息学方法,对NCBI上已公布的35种象甲科物种线粒体全基因组序列进行了分析。结果显示:(1)象甲科tRNA基因存在排序及数目异常情况,不同物种中蛋白质编码基因和2种rRNAs排列相同,线粒体全基因组具有明显AT偏向;(2)COX1、ATP6、ND5、ND4、ND4L和ND1基因除标准三联密码子外,还存在特殊的起始密码子AAT、TTG和GTG;(3)13种蛋白质编码基因的进化速率顺序为COX3ATP8ND2ND5ND1ND4ND6ND4LND3ATP6CytbCOX1COX2;(4)13个蛋白编码基因和rRNAs基因中,ND5、rrnL、ND4和ND2基因变异位点数较高,可作为备选的分子标记;(5)各亚科的系统发育关系可能为(((小蠹亚科Scolytinae+长小蠹亚科Platypodinae)+(隐喙象亚科Cryptorhynchinae+魔喙象亚科Molytinae+象虫亚科Curculioninae)+((孢喙象亚科Cyclominae+粗喙象亚科Entiminae)+(隐颏象亚科Dryophthorinae+长小蠹亚科))),为象甲科的系统发育分析有提供参考。
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关 键 词: | 象甲科 线粒体基因组 基因重排 进化 系统发育 |
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