| MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用——序列比对(二) |
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| 引用本文： | 李红燕,刘新星,谢建平,杨英杰.MATLAB 7.X生物信息工具箱的应用——序列比对(二)[J].现代生物医学进展,2008,8(2):351-353,350. |
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| 作者姓名： | 李红燕 刘新星 谢建平 杨英杰 |
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| 作者单位： | 中南大学生物冶金教育部重点实验室,湖南,长沙,410083 |
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| 摘 要： | 序列比对是基因序列分析中的一项重要工作.本文以人和鼠的基因为对象,介绍MATLAB 7.X生物信息工具箱中的序列比对方法,内容包括从数据库获取序列信息,查找序列的开放阅读框,将核苷酸序列转换为氨基酸序列,绘制比较两氨基酸序列的散点图,用Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法进行比对,以及计算两序列的同一性.
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| 关 键 词： | 序列比对 开放阅读框 序列散点图 同一性 Application of MATLAB 生物信息 工具箱 应用 序列比对 Toolbox Bioinformatics Contrast 同一性 计算 算法 散点图 比较 绘制 氨基酸 转换 核苷酸 开放阅读框 查找 序列信息 |
| 文章编号： | 1673-6273（2008）02-0351-03 |
| 收稿时间： | 2007-11-07 |
| 修稿时间： | 2007-12-16 |
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