| 摘 要： | 【目的】基于线粒体基因组数据;明晰云南省橘小实蝇Bactrocera dorsalis种群遗传多样性和遗传结构;揭示其在云南的扩散路径;为橘小实蝇防控策略的制定和规划提供理论依据。【方法】2022年7-9月收集云南省橘小实蝇15个地理种群;使用DNBSEQ-T7平台进行线粒体基因组测序、组装与注释;基于13个蛋白质编码基因(protein-coding genes, PCGs)序列使用MEGA-X 10.0.5, DnaSP 6.12和Arlequin 3.5.2软件分析种群遗传多样性与遗传分化;基于13个PCG和COI序列使用最大似然法构建系统发育树;使用PopART4.8.4软件构建单倍型网络;通过中性检验和错配分布分析种群历史动态。【结果】共获得云南橘小实蝇15个地理种群149条线粒体全基因组;包含共1 697个变异位点;总体表现出高水平的遗传多样性(Pi=0.00783; K=87.591; Hd=0.9994);种群间遗传距离为0.00702~0.00874;遗传分化指数为-0.02345~0.05203;系统发育树和单倍型网络均未呈现出明显的种群结构;橘小实蝇云南种群历史上发生过扩张;云南西部和南部为橘小实蝇最早入侵区域;北部地区橘小实蝇入侵时间较晚。【结论】云南省橘小实蝇不同组群均呈现出高水平遗传多样性和弱遗传结构;线粒体基因组变异位点丰富且广泛分布在所有种群中;不同地理种群间没有明显分化;推测橘小实蝇由云南西部及南部向北部地区扩散。
|
